高通量染色体构象捕获技术(High-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)是一种用于研究基因组中染色体的三维结构分子生物学技术。它通过对DNA进行特殊的修饰和捕获,然后对修饰后的DNA进行测序,来确定基因组中不同区域之间的相互作用。这种技术可以帮助研究人员了解基因的功能和调控,以及在染色体中的不同位置的基...
染色体构象捕获技术原理染色质构象捕获技术(Chromatin Conformation Capture,简称3C)是用于研究染色质空间结构的方法。它可以帮助我们理解基因组中基因调控的机制、染色体的折叠方式以及基因与基因之间的相互作用。 下面是3C技术的原理: 固定:首先,将细胞或组织固定化,以保持染色质在原来的三维结构中。常用的固定剂是甲醛,...
为解决Hi-C技术中的出现的一些问题,最新的这项研究提供了一种新的DLO Hi-C(digestion-ligation-only Hi-C)染色体构象捕获技术,采用同时酶切酶连的方式,将DNA接头连接在染色体内切酶切口末端上,然后进行邻近酶连,最后将用MmeI内切酶酶切消化,回收固定大小互作DNA片段(下图),从而大大地降低了背景数据噪音,获取质量高...
capture technology involve fixing cells to preserve their spatial organization, digesting the chromatin to fragment the DNA, and capturing physical interactions between distant genomic regions.染色体构象捕获技术背后的原理包括固定细胞以保留其空间结构,消化染色质以使DNA断裂,并捕获远程基因组区域之间的物理相互...
Hi-C技术是三维基因组学的主要研究方法,但存在实验成本高、数据噪音大、实验过程繁琐等缺点。为解决这些问题,来自华中农业大学的研究人员近期提出了一种新染色体构象捕获技术——DLO Hi-C,这种方法降低了背景数据噪音,高质量低成本获取Hi-C...
染色体构象俘获技术是(chromosome conformation capture，3C)通过一种定量手段(PCR产物的有和无、产量的高和低)对DNA之间是否存在相互作用这一定性问题进行研究。主要经过甲醛交联、限制性酶切、稀释和连接、解交联、DNA纯化与PCR鉴定。通过一对分别与选定的2段DNA配对的引物进行PCR扩增，通过PCR产物的有无、...
染色体构象捕获技术(3C)[1]3C技术主要通过将细胞内的染色质进行固定，然后使用能够识别6个碱基的限制性...
高通量染色体构象捕获(Hi-C)是在整个基因组水平上的功能,旨在测序和检测样品中所有可能的三维相互作用,实验流程如下。Hi-C大部分的努力都发生在生物信息学和解释的水平上,这些实验最常用于检查细胞在发育过程中或经过特定治疗后染色质景观的整体变化。 此外,越来越多的混合技术使用“C”方法为核心,例如,“Capture-Hi...
华中农业大学的研究人员近期发表了题为“Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture”的文章,提出了一种新染色体构象捕获技术——DLO Hi-C,这种方法降低了背景数据噪音,高质量低成本获取Hi-C数据。