近日,中国农业科学院棉花研究所(以下简称棉花所)棉花分子遗传改良创新团队在染色体三维结构方法(Hi-C)改进领域取得重要进展,开发出了“冷冻置换Hi-C”技术,填补了该领域利用冷冻样本研究染色体三维构象的空白,使Hi-C技术更灵活便捷。相关研究成果在线发表在《遗传学与基因组学杂志》上,并被选为封面文章。 团队首席、...
Micro-C XL的超高分辨率三维结构应用独白 真核生物染色体折叠的结构已被染色体构象捕获系列技术持续深入分析,染色体构象捕获系列技术使用交联基于空间邻近连接的位点来估计接触频率,从而得到多个层级的三维染色体结构,例如compartment、TAD,以及CTCF和黏连蛋白介导的染色质loop。 用于染色质构象捕获的Hi-C技术已臻成熟,广泛应...
近日,中国农业科学院棉花研究所棉花分子遗传改良创新团队在染色体三维结构方法(Hi-C)改进领域取得重要进展,开发出了“冷冻置换Hi-C”技术,填补了该领域利用冷冻样本研究染色体三维构象的空白,使Hi-C技术更灵活便捷。相关研究成果在线发表在《遗传学与基因...
据中国农科院最新消息,该院棉花研究所棉花分子遗传改良创新团队开发出“冷冻置换染色体三维结构方法(Hi-C)”技术,填补了Hi-C领域利用冷冻样本研究染色体三维构象的空白,使Hi-C技术更灵活便捷、构象更真实准确。相关研究成果以封面文章形式在线发表于《遗传学与基因组学杂志(Journal of Genetics and Genomics)》。 团队...
Hi-C技术是染色体构象捕获(Chromosome conformation capture,简称为3C)的一种衍生技术,是指基于高通量进行染色体构象的捕获,它能够在全基因组范围内捕捉不同基因座位之间的高分辨率空间交互信息,研究三维空间中调控基因的DNA元件。与WGS、RNA-seq、ATAC-seq、 CUT&Tag等多组学联合分析,研究不同物种基因组空间结构(compar...
研究比较獐、小麂和黑麂的染色体数目呈阶梯变化的物种基因组三维构象发现,尽管它们的染色体数目差异巨大,但在染色体区室(compartment A/B)层面相差甚小,表明染色体剧烈演化对这些物种大尺度三维构象的影响很小。另外,研究比较neo-X和neo-Y倒位区的多种序列特征发现,在neo-Y倒位区聚集了大量染色质构象的转换(...
(Muntiacus reevesi,2n=46),雌性和雄性黑麂(Muntiacus crinifrons,2n=8/9)的染色体水平基因组,以及贡山麂(Muntiacus gongshanensis,2n = 8/9)的草图基因组,并结合三维基因组的Hi-C数据,深入研究了麂属物种染色体进化的分子机制,揭示了剧烈的染色体进化对三维染色质结构的影响,并为麂属动物的早期进化提供了深入的...
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