覆盖度的问题也就造成该技术不适用于全基因组测序。 Hi-C(全部互作) 高通量基因组捕获技术,基本解决了上述技术的缺点,可以实现全基因组覆盖检测全部未知互作区域。 2、基于免疫沉淀技术 ChIP-loop 该技术将 3C 与 ChIP-seq 结合,可以检测目的蛋白质介导的两个目的基因区域互作。 ChIA-PET 该技术将 HiC 与 ChIP...
该研究使用Illumina技术对油用亚麻品种Longya-10、纤维亚麻品种Heiya-14和pale flax分别进行测序与组装,后期利用HiC技术与遗传图谱辅助Longya-10基因组组装,将434 scaffolds组装至染色体水平。通过比较基因组及群体进化等研究探索油用及纤维用亚麻在驯化中受到的选择作用,以及可能在重塑亚麻形态结构中起着至关重要作用的...
这种情况,你可以认为是环化reads打断后,两端的reads不能提供有效信息,具体可能是超声波打断的随机性,环化拼接的随机性等等,所以需要筛掉,因为这些信息只能提供错误的信号,导致无法合理分染色体,分方向。往往如果hic热图不合理,建议查看有效数据量是否达标以及可以尝试用该数据去挂载同源已发表的物种,以此判断是数据问题还是...
在4C的基础上，5C技术添加了标签，能检测多种点之间的相互作用，进一步增强了检测能力。Hi-C技术则是通过甲醛交联、限制酶切割、末端补平添加生物素、平末端连接、超声破碎、生物素富集、建立库并进行测序，整个过程中没有特异性引物。Hi-C技术凭借高通量测序，展示了整个染色体中的全部相互作用关系。ChIA...
5C技术是在4C的技术上，加了个tag标签，导致可以检测many-to-many的相互作用。没啥说的。 Hi-C的基本步骤是，甲醛交联，限制酶切，末端补平加biotin，平末端连接，超声破碎，biotin富集，建库测序。整个过程是没有特异性引物存在的。而且依靠高通量的测序技术，Hi-C可以展现出，整个染色体all-to-all的...
基于高通量测序技术的Hicpro结果可视化软件是由南京集思慧远生物科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2023SR0618072,属于分类,想要查询更多关于基于高通量测序技术的Hicpro结果可视化软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
这个技术是用特异性抗体富集interaction信息。比如CTCF，比如pol II的抗体，然后类似的步骤，建库测序。