染色体构象捕获碳拷贝(Chromosome conformation capture carbon copy,5C) ,可以检测某段区域内所有的互作,但是该区域一般<1 Mb。覆盖度的问题也就造成该技术不适用于全基因组测序。 Hi-C(全部互作) 高通量基因组捕获技术,基本解决了上述技术的缺点,可以实现全基因组覆盖检测全部未知互作区域。 2、基于免疫沉淀技术 Ch...
使用超声波或其他方式,再次打断片段。 6、上机测序 用磁珠将带生物素的捕获,制作文库,上机测序。 三、三维基因组检测技术比较 下图展示了目前主流三维基因组测序技术3: 1、C技术 3C(一对一) 基因组捕获技术(Chromosome conformation capture,3C)是最早研究三维基因组的技术,需要提前知...
染色体构象捕获碳拷贝(Chromosome conformation capture carbon copy,5C) ,可以检测某段区域内所有的互作,但是该区域一般<1 Mb。覆盖度的问题也就造成该技术不适用于全基因组测序。6 Hi-C(全部互作) 高通量基因组捕获技术,基本解决了上述技术的缺点,可以实现全基因组覆盖检测全部未知互作区域。 2、基于免疫沉淀技术 ...
X plus 测序平台 信息分析 基于全基因组的互作信息,获得高分辨率的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。 关联分析 基于多组学文章中的应用场景和经验,诺禾致源搭建了内容丰富的Hi-C与RNA-seq关联分析流程,以助力科研者们发表高分文章。 送样建议...
诺禾致源表观组产品线拥有丰富的表观和转录调控类测序分析经验,支持全世界科研工作者发表高分文章500+篇,影响因子累计5000+,涉及的组学包括但不限于ATAC-seq、CUT&Tag、EM-seq、Hi-C、RNA甲基化(MeRIP-seq)、Ribo-seq、RNA IP-seq(RIP-seq)、芯片检测类和脱靶检测类等。
Hi-C是一种分析染色体空间构象的高通量测序技术,它有助于研究者理解染色体三维空间结构、染色体之间相互作用以及基因表达的空间调控机制,相关结果深化了对组织发育和癌症发生等过程的认识。而这种技术的诞生,缘起于科学家对染色体及其结构持续不断的探索。 染色体是一种存在于...
Hi-C 是一种基于测序的方法，用于分析全基因组染色质互作。它已广泛应用于研究各种生物学问题，如基因...
Hi-C是2009年提出的染色体构象捕获结合高通量测序的一种技术(Erez Lieberman-Aiden, et al,Science),是衍生于染色体构象捕获技术(3C)的高通量技术,实现了全基因组范围内的染色体片段间的相互作用的捕获检测。作为染色体三维构象与互作研究的利器,Hi-C技术广泛...
前一段时间,和导师交流实验进展,导师问我Hi-C的结果大约得多久才出来,我想着Hi-C测序本质上还是二代测序,参考二代测序建库及测序的时间,说得一周吧,同时和公司确定了一下,结果公司说至少得一个月,非常惊讶,咋这么慢,公司说建库很复杂,用时间比较多,中间还有小数据上机测序,评估过程等等。和公司要了一些建库的...