但是当分辨率在千基尺度(kilobase)时,复杂的结构和数据分布使Hi-C接触热图变得嘈杂。迄今为止,染色质环的全基因组图谱,特别是TADs中的增强子启动子相互作用,仍然是Hi-C分析的一个主要挑战。因此,科学家们开发了相关技术,比如通过对端标签测序(ChIA-PET)分析染色质相互作用,启动子捕获Hi-C(pcHi-C), HiChIP/邻近...
中国科学院水生生物研究所何舜平课题组通过运用二代、三代测序技术(Nanopore),并结合Hi-C互作图谱技术辅助基因组组装,获得了一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组——DrAB1。 相比于目前的Tubingen品系斑马鱼参考基因组(GRCz11),DrAB1的基因组质量提高了15倍(contig N50),基因组的缺口数量也从925个减少到134个,使得...