之后,科学家们扩展了3C技术,开发了4C(Circularized Chromatin Conformation Capture)技术,用于测定一点与多点之间的染色质交互作用。Dostie等人开发了5C(Carbon-Copy Chromatin Conformation Capture)技术,用于测定多点与多点之间的交互作用。为了能捕获全基因组范围所有的染色质互作信息,Job Dekker研究团队于2009年开发...
高通量染色体三维构象捕获技术Hi-C(High-throughput chromosome conformation capture)作为国自然热点前沿技...
但实际上,Hi-C辅助基因组组装仅仅只是Hi-C技术强大功能体系中的一小部分而已,作为高通量的染色质构象捕获技术(High-throughput Chromatin Conformation Capture),其强大的功能更多地是应用于基因组三维结构的解析和破译。
Hi-C 技术源于基因组捕获技术(Chromosome conformation capture,3C),是分析染色质三维空间结构的一种测序方法,用于研究三维基因组。 什么是三维基因组? 白墨:一文读懂三维基因组(图文详解)323 赞同 · 15 评论文章 用途: 量化在三维空间中基因组的染色质间交联(cross-linked chromatin ) ...
2003年Job Dekker及其合作者提出了染色质构象捕获技术(Chromatin Conformation Capture, 3C),用于测定特定的点到点之间的染色质交互作用。随后,科学家们扩展了3C技术,开发了4C技术(Circularized Chromatin Conformation Capture),用于测定一点到多点之间的染色质交互作用。Dostie等人接着开发了5C技术(Carbon-Copy Chromatin ...
Hi-C技术是源于基因组捕获技术(Chromosome conformation capture,3C),用来分析染色质三维空间结构的一种测序方法,主要是研究生物的3D基因组。自从2009年Hi-C技术首次被提出后,3D基因组的研究迎来了爆炸式的发展,相关的论文发表量增长了约6倍,可见其火爆。
【4】Bickhart D M, Rosen B D, Koren S, et al. Single-molecule sequencing and chromatin conformation capture enable de novo reference assembly of the domestic goat genome[J]. Nature Genetics, 2017, 49(4): 643-650. 【5】Mostovoy Y, Levy-Sakin M, Lam J, et al. A hybrid approach for...
Hi〤 is a chromosome conformation capture (3C)‐based technology to detect pair﹚ise chromatin interactions genome﹚ide, and has become a benchmark tool to study genome organization. In Hi〤, chromatin conformation is first captured by chemical cross﹍inking of cells. Cells are then lysed and ...
传统的方法主要借助电子显微镜技术,受分辨率所限,无法获得较清晰的图像。2002年,哈佛大学德克尔(J. Dekker)小组首先发明染色体构象捕获(chromosome conformation capture)技术[1],从而为解析染色体3D结构奠定了坚实基础,由于该技术3个英文单词的首字母均为C,故又称3C技术。