meta_fixed <- rma(effect, se, data = data_combined, method = "FE" # 查看Meta结果 summary(meta_fixed) 参考: 【1】Fongang B; Mega Vascular Cognitive Impairment and Dementia (MEGAVCID) consortium. A genome-wide association meta-analysis of all-cause and vascular dementia. Alzheimers Dement....
(2) Meta-level QC(步骤19-26) 比较不同文件的特定文件的统计数据,以描述特定研究的问题 如果特定研究的问题不能集中解决,,应联系相关的研究分析师澄清 (3) Meta-analysis (步骤27-28) meta分析实际进行的阶段 通常由两个分析师独立进行 (4)Meta-analysis QC (步骤29-32) 包括检查 meta分析结果,比较两个不...
✅PGC (Psychiatric Genomics Consortium)网站提供了抑郁症,双相情感障碍,精神分裂症等精神疾病的GWAS summary data,由多个机构合作完成了多个大样本量的GWAS meta分析。数据下载需注册账号。 网址:med.unc.edu/pgc/ ✅SSGAC (Social Science Genetic Association Consortium)提供了教育水平,经济和政治取向,人格等行为...
META是一种思想概念,一种抽象思维,用来描述数据的数据,比如有一张学生表,记录着学生的基本信息,我们通过表可以获取学生信息(数据),但是有时候也要得到表本身的信息数据(比如表结构信息:字段名称,字段数据类型,长度等信息),对于这种基础信息的描述,就会使用META的概念,使用META元数据来描述表本身。放到HTML中也是一样...
当已知几个独立的遗传变异与感兴趣的暴露相关时,可以使用单个Wald比率估计值的inverse variance weighted meta-analysis将它们合并为单个MR估计值,可以将这种看作是Meta analysis。 证明违反第三个假设,即遗传工具仅通过暴露影响结果,不会引起偏差有一系列的敏感性分析Mendelian randomization with invalid instruments: effec...
MAGMA是一个能够做gene analysis 和gene-set analysis的GWAS数据分析软件。该软件使用的数据可以是基因型文件数据(比如plink 的bfile),也可以是GWAS或meta-analysis结果中的P-vaule。 其中, 基因和基因集分析是同时分析多个遗传标记以确定其联合效应的统计方法。这种方法的优点,首先是其大大减少了计算量,其次是可能检测...
这个软件的英文介绍是MAGMA is a tool for gene analysis and generalized gene-set analysis of GWAS data. It can be used to analyses both raw genotype data as well as summary SNP p-values from a previous GWAS or meta-analysis. 即此软件既可以分析基因水平又可以分析生物通路水平,既可以分析GWAS的...
Essential tremor (ET) is a prevalent neurological disorder with a largely unknown underlying biology. In this genome-wide association study meta-analysis, comprising 16,480 ET cases and 1,936,173 controls from seven datasets, we identify 12 sequence vari
这个软件的英文介绍是MAGMA is a tool for gene analysis and generalized gene-set analysis of GWAS data. It can be used to analyses both raw genotype data as well as summary SNP p-values from a previous GWAS or meta-analysis. 即此软件既可以分析基因水平又可以分析生物通路水平,既可以分析GWAS的...
GWAS meta-analysis of intrahepatic cholestasis of pregnancy implicates multiple hepatic genes and regulatory elementsPeter H. Dixon, Adam P. Levine, Inês Cebola, Melanie M. Y. Chan, Aliya S. Amin, Anshul Aich, Monika Mozere, Hannah Maude, Alice L. Mitchell, Jun Zhang, NIHR...