▣ 数据库查询的综合性应用 本节探讨了如何有效地查询和使用综合数据库，特别强调了IEU数据库的特色，并给出了在R语言中查询数据的具体代码示例。▣ 综合数据库概览 以IEU数据库为例，它是一个庞大的综合性数据库，汇集了众多专科的GWAS数据。通过访问，研究人员能够快速获取大量关于人体测量特征、精神疾病发病机理...
R包中的TwoSampleMR是双样本孟德尔随机化(Two Sample Mendelian Randomization)分析的利器,依赖于IEU GWAS database数据库中的公开GWAS信息。所有纳入IEU GWAS database的表型都可以很容易的作为exposure或outcome被提取并进行孟德尔随机化分析。 但是,IEU GWAS database并不是万能的!还有大量最新野生GWAS结果未被收录到IE...
为简化流程，本文提供了一份详细指南。eQTL数据来源自广泛使用的eQTLGen数据库，选择的是IEU数据库提供的VCF文件，可直接在网站下载，无需解压。GWAS数据则来自芬兰的FinnGen数据库，R9版本的数据下载指南可查阅相关链接。所有下载的数据无需解压，直接放置于工作目录即可。代码设计简易，仅需修改数据文件路径。