在GWAS ID后面的框里输入ieu-a-2,然后点击Filter,在出来的结果中点击ieu-a-2这个结果: 就可以来到下载界面,点击Download VCF即可下载暴露数据的完整的GWAS数据: 下载结局数据也是完全一样的流程,就不重复演示了。我这里为了和前面的在线获取进行比较,结局也选择的是ieu-a-7。 两个数据都下载后是这样的: 这样一个暴露的数据
1.获取基因的ENS号,以CA2为例,在NCBI中查询基因: 可选择人属性或者其他如大小鼠,这里以人为例: 直接复制图中的ENS号“ENSG00000104267” 2.打开网站,输入ENS号,点击搜索 IEU OpenGWAS project 点击直接下载VCF文件,获得相关数据。
目的：通过分析FinnGen数据库中的大规模欧洲人群样本数据，明确组织蛋白酶与骨坏死之间的潜在因果关系，并探讨其可能的作用机制。方法：从FinnGen数据库获取骨坏死相关数据，包括R9(共359399样本量：1385例病例和358014例对照)和R10版本(共392580样本量：1543例病例和391037例对照)。随后从以往研究(3301例)中获得了与9...
首先推荐给大家的第一个GWAS数据库就是——IEU OpenGWAS project (mrcieu.ac.uk) 优点:可以和TwoSampleMR包完美配合,十分方便 缺点:数据部分时间有点old,而且大部分我们感兴趣的数据其实不能通过R包进行完美下载 那么,第二个GWAS数据库是——UK Biobank—Neale lab 优点:数据...
Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) is a prevalent endocrine and metabolic disorder. Research suggests a potential link between certain micronutrients and PCOS development, but the exact cause-and-effect relationship is unclear. This research utilizes data from extensive genome-wide association studies (GWAS...
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Data generated by genome-wide association studies (GWAS) are growing fast with the linkage of biobank samples to health records, and expanding capture of high-dimensional molecular phenotypes. However the utility of these efforts can only be fully realised if their complete results are collected from...
MRC-IEU OpenGWAS API Source code for backend ofhttps://gwas.mrcieu.ac.uk/. Seeherefor more details. Elsworth B, Lyon M, Alexander T, Liu Y, Matthews P, Hallett J, Bates P, Palmer T, Haberland V, Davey Smith G, Zheng J, Haycock P, Gaunt TR, Hemani G. The MRC IEU OpenGWAS ...
R语言爬取IEU OPEN GWAS,感觉不得劲#数据分析 #sci #干货分享 #科研狗的日常 - 医小研于20231031发布在抖音,已经收获了7622个喜欢,来抖音,记录美好生活!
微信小程序error:enoent:no such file or directory,open 怎么回事 导致这个问题应该是你添加了文件,后面删除了,重新编译就会提示no such file or directory,ope 共享文件软件-超大存储极速传输-异地多人协作 共享文件软件,专业文件共享,超大文件存储空间,多人多端同步共享文件,支持多种文件格式免费在线编辑,团队高效共...