GTEx GTEx,全称Genotype-Tissue Expression。这个数据库和TCGA和ICGC不同的是。TCGA和ICGC更多的还是肿瘤相关的数据,而GTEx收集的是正常人身上的组织来进行的测序,所以GTEx数据库包括的就只是正常人的数据。 这个数据集的用处呢,一方面是可以研究正常人不同组织之间的基因表达的区别。另外的一个呢,就是和TCGA联合使用。
GTEx全称如下 Genotype-Tissue Expression 该项目对来自人体多个组合和器官的样本,同时进行了转录组测序和基因分型分析,构建了一个组织特异性的基因表达和调控的数据库。网址如下 https://gtexportal.org/home/ 包含的组织类型和样本个数如下图所示 对于所有的样本,主要进行了以下三种分析 1. RNA seq 通过illumina Tr...
GTEx，全称为GenotypeTissue Expression，是一个由美国国立卫生研究院资助的长达十年的项目。目的：该项目的目的是深入研究人类不同组织的特异性基因表达和调控。数据规模与内容：GTEx数据库汇集了838位生前健康的捐献者的DNA信息，包括全基因组测序和全外显子测序。数据库包含17382份RNAseq数据，涉及54个组...
GTEx全称Genotype-Tissue Expression，是基因型组织表达的缩写。它源于2013年Nature Genetics上的一篇开创性文章，Genotype-Tissue Expression project，揭示了基因在不同组织中的表达模式。随后，GTEx联盟诞生，并在2015年的Science杂志上发表了关于多组织基因调控的《Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analy...
The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: Multitissue gene regulation in humans The human transcriptome across tissues and individuals Effect of predicted protein-truncating genetic variants on the human transcriptome 二期 在2017年,一次性在nature发表4篇研究成果,GTEx研究联盟的研究收集并研究了来...
答:GTEx全称是Genotype-Tissue Expression,称为基因型组织表达。GTEx首次出现是2013年在Nature Genetics杂志上发表的文章The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project中,该文中首次介绍了Genotype-Tissue Expression,并成立了Genotype-Tissue Expression Consortium。2015年发表在Science上标题为The Genotype-Tissue Expression...
GTEx首次出现是2013年在Nature Genetics杂志上发表的文章The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project中,该文中首次介绍了Genotype-Tissue Expression,并成立了Genotype-Tissue Expression Consortium。2015年发表在Science上标题为The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: Multitissue gene regulation in ...
大家好，今天来聊聊在生信分析中不可忽视的GTEx数据库。GTEx，全称为Genotype-Tissue Expression，意为基因型组织表达。这个数据库首次在2013年Nature Genetics杂志上发表的文章《The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project》中出现，随后在2015年的Science杂志上发表的《The Genotype-Tissue Expression (...
GTEx全称为Genotype-Tissue Expression，是基因型组织表达的简称。该数据库于2013年首次在Nature Genetics杂志上发表的文章中提出，其目的是通过收集个体内不同组织的遗传表达变化来检查基因型组织表达。随后在2015年的Science杂志上，对GTEx进行了深入的分析和研究。该数据库收集了来自1641个尸检样本的54个个体...
GTEx数据库是Genotype-Tissue Expression (GTEx)项目的一部分,旨在分析人类组织和基因型之间的关系。该数据库提供了来自超过50种不同组织的基因表达数据,可以帮助研究人员了解基因在不同组织中的表达模式。此外,GTEx数据库还提供了基因变异、遗传关联等信息,为研究人员进一步探索基因与疾病之间的关系提供了基础。