gtdbtk check_install [2024-05-2014:10:37]INFO:GTDB-Tkv2.3.2[2024-05-2014:10:37]INFO:gtdbtk check_install[2024-05-2014:10:37]INFO:UsingGTDB-Tkreference data version r214:/data/home/jianglab/share/GTDB_r214/release214/[2024-05-2014:10:37]INFO:Runninginstall verification[2024-05-2014:1...
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GTDB-Tk是一个软件工具包,用于根据基因组数据库分类法GTDB为细菌和古细菌基因组分配客观的分类法。它旨在与最近的进展一起使用,从而可以直接对环境样本中获得数百或数千个由基因组组装的基因组(MAG)进行物种分类注释。它也可以用于分离和单细胞的基因组物种注释。 本次测试版本为 GTDB-Tk v1.3.0,于2020年7月17...
GTDB：基因组分类数据库，物种注释和进化树构建工具GTDB-tk
GTDB-Tk is described in: Chaumeil PA, et al. 2022.GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the Genome Taxonomy Database.Bioinformatics, btac672. Chaumeil PA, et al. 2019.GTDB-Tk: A toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database.Bioinformatics, btz848. ...
export_msa -> Export the untrimmed archaeal or bacterial MSA file 导出未剪裁的细菌/古菌多序列对齐文件 remove_labels -> Remove labels (bootstrap values, node labels) from an Newick tree 从Newick树中移除标签 convert_to_itol -> Convert a GTDB-Tk Newick tree to an iTOL tree 从Newick树中移除...
内容提示: Genome analysisGTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with theGenome Taxonomy DatabasePierre-Alain Chaumeil*, Aaron J. Mussig , Philip Hugenholtz andDonovan H. Parks*Australian Centre for Ecogenomics, School of Chemistry and Molecular Biosciences, The University of Queensland, St Lucia,...
GTDB-Tk是一个软件工具包,用于根据基因组数据库分类法GTDB为细菌和古细菌基因组分配客观的分类法。它旨在与最近的进展一起使用,从而可以直接对环境样本中获得数百或数千个由基因组组装的基因组(MAG)进行物种分类注释。它也可以用于分离和单细胞的基因组物种注释。
一、胡文担任职务:担任武汉鑫奇点网络科技有限公司监事;二、胡文投资情况:胡文目前是武汉鑫奇点网络科技有限公司直接控股股东,持股比例为70%;目前胡文投资武汉鑫奇点网络科技有限公司最终收益股份为70%;三、胡文的商业合作伙伴:基于公开数据展示,胡文与吴健为商业合作伙伴。 财产...
GTDB-Tk: a toolkit for assigning objective taxonomic classifications to bacterial and archaeal genomes. - Ecogenomics/GTDBTk