使用conda命令安装GROMACS: 一旦你找到了正确的包名,就可以使用conda命令来安装GROMACS。例如,如果你想要安装GROMACS 2023版本,可以输入以下命令: bash conda install -c bioconda gromacs=2023 这里,-c bioconda指定了从bioconda这个conda频道安装GROMACS。如果GROMACS不在默认的conda频道中,你可能需要指定其他频道。 验证...
conda安装Gromacs 创建虚拟环境 conda create -n gmx 激活虚拟环境 conda activate gmx 搜索可构建的gromacs版本 conda search gromacs -c conda-forge 安装gromacs conda install gromacs=2023.3=nompi_cuda_h6303bc7_3 -c conda-forge
conda create --name Amber24 python=3.12 conda activate Amber24 conda install -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ ambertools AmberTools就安装好了 Gromacs # 创建conda环境 conda create --name gmx python=3.10 conda activate gmx cudatoolkit我这台机子已经有了就不说了...
详细版本-用conda安装gromacs特大柚子皮 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 3866 4 07:43 App 催更版本-蛋白对接蛋白结果在线网站分析 2389 1 11:32 App 录音版本-关于在windows安装linux安装wsl 2561 3 18:36 App 补充版本-怎么补全缺失的氨基酸 2316 4 03:46 App 录音版本-蛋白对接蛋白网站...
conda install -c openbabel openbabel conda install matplotlib networkx pip # 使用pip安装pymbar和alchemlyb pip install pymbar alchemlyb==0.6.0 下面我们需要将PyAutoFEP添加环境变量,并赋予python文件可执行权限。注意修改文件路径。 echo "export PATH=../PyAutoFEP:$PATH" ...
config --add channels conda-forge）后，然后安装时只需要conda create -n base_name -c conda-...
config --add channels conda-forge）后，然后安装时只需要conda create -n base_name -c conda-...
condacreate -n acpypemd python=3.8condaactivate acpypemdcondainstall -c conda-forge acpype 力场转化: acpype -plig.prmtop-xlig.inpcrd-d 二、蛋白模拟 1. 蛋白力场生成 由于用的ff14sb,需要下载力场文件: https://github.com/intbio/gromacs_ff ...
conda install -c conda-forge gmx_mmpbsa -y 文件准备 在使用gmx_MMPBSA程序进行MM/PBSA结合自由能计算之前,需要准备好以下文件: 本文假定这些文件放在同一个目录里。 经过长时间的动力学模拟,体系很容易出现由PBC引起的问题,包括:跨周期漂...
因为厦门大学吴安安课题组提出计算C NMR 的SVM方法会用到environment module这个类似aconda的软件,所以需要安装。 4.1 module安装 yum install tcl tcl-devel 可尝试yum install environment-modules,若不行,进行手动安装。 tar -zxvf modules-5.3.1.tar.gz ...