可以使用 Conda 来安装 Gromacs。 Gromacs 是一个广泛使用的分子动力学模拟软件,可以通过 Conda 包管理器进行安装。以下是使用 Conda 安装 Gromacs 的步骤: 确保已安装 Conda: 如果还没有安装 Conda,可以从 Anaconda 官网 下载并安装。 添加Conda Forge 通道: Conda Forge 是一个由社区维护的 Conda 通道,提供了许...
conda create --name Amber24 python=3.12 conda activate Amber24 conda install -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ ambertools AmberTools就安装好了 Gromacs # 创建conda环境 conda create --name gmx python=3.10 conda activate gmx cudatoolkit我这台机子已经有了就不说了...
conda安装Gromacs 创建虚拟环境 conda create -n gmx 激活虚拟环境 conda activate gmx 搜索可构建的gromacs版本 conda search gromacs -c conda-forge 安装gromacs conda install gromacs=2023.3=nompi_cuda_h6303bc7_3 -c conda-forge
因为厦门大学吴安安课题组提出计算C NMR 的SVM方法会用到environment module这个类似aconda的软件,所以需要安装。 4.1 module安装 yum install tcl tcl-devel 可尝试yum install environment-modules,若不行,进行手动安装。 tar -zxvf modules-5.3.1.tar.gz cd modules-5. 3.1 /configure --prefix=/usr/local/Modu...
file:///C:/Users/admin/AppData/Local/Temp/msohtmlclip1/01/clip_image026.jpg自此新系统安装完成...
不使用 conda 安装的原因是 conda 提供的版本比较老,可能出现报错“Could not cast attribute: Unable to cast H to Tensor”的问题。检查自己是否有该错误的方法为,将上面代码的最后一行取消注释,如能正常执行,证明安装版本没问题。 安装好两个程序后,通过如下 Python 代码使用TorchANI 的 TorchScript 导出预训练...
安装步骤 在Linux系统上安装GROMACS通常需要以下几个步骤: 1. 安装依赖 首先,确保系统上安装了必要的依赖包: 代码语言:txt 复制 sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential cmake g++ gfortran libboost-all-dev libopenmpi-dev libfftw3-dev liblapack-dev libblas-dev ...
由pdb文件生成拓扑文件本文档转写自gromacs教程,用以记录学习过程gromacs推荐使用conda安装:conda install -c biocondagromacs下载pdb文件:从RCSB 其检索号为1aki,wget下载即可去除水分子 对于不需要水分子的模拟,需要用命令除去水分子grep -v HOH 1aki.pdb > 1AKI_clean.pdb生成拓扑文件gmx p ...
由pdb文件生成拓扑文件本文档转写自gromacs教程,用以记录学习过程 gromacs推荐使用conda安装:conda install -c bioconda gromacs下载pdb文件:从RCSB 其检索号为1aki,wget下载即可去除水分子 对于不需要水分子的模拟,需要用命令除去水分子grep -v HOH 1aki.pdb > 1AKI_clean.pdb生成拓扑文件gmx p gromacs无法使用gpu...
详细版本-用conda安装gromacs特大柚子皮 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 3866 4 07:43 App 催更版本-蛋白对接蛋白结果在线网站分析 2389 1 11:32 App 录音版本-关于在windows安装linux安装wsl 2561 3 18:36 App 补充版本-怎么补全缺失的氨基酸 2316 4 03:46 App 录音版本-蛋白对接蛋白网站...