protein-structureproteinrepresentation-learningprotein-sequencepredicted-structurespretrainingstructure-awareprotein-language-modelalphafold2foldseekstructural-alphbetprotein-llm UpdatedMar 4, 2025 Python baaihealth/OpenComplex Star243 Trainable PyTorch framework for developing protein, RNA and complex models. ...
This package provides an implementation of the inference pipeline of AlphaFold v2. For simplicity, we refer to this model as AlphaFold throughout the rest of this document.We also provide:An implementation of AlphaFold-Multimer. This represents a work in progress and AlphaFold-Multimer isn't exp...
六个月前，AlphaFold3横空出世震撼了整个学术界。AlphaFold的开发人也凭借它在上个月赢得了诺贝尔化学奖。然而，这个诺奖级AI的「不开源」一直引起学界的不满。谷歌DeepMind只推出了一个免费研究平台「AlphaFold Server」，而且该服务有每日的次数限制。相比于开源的AlphaFold2来说，这种使用方式缺失了很多自由度。好在它...
在AlphaFold2 的案例背后,我们可以看到非结构化数据应用的基本模式:其一,对非结构化数据中的关键信息进行编码,通过已有的海量数据构建解空间;其二,基于语义匹配,将初始问题转化为对解空间的搜索;三,对搜索结果的拼合等后处理。这一基本模式可帮助人类有效解决内容推荐、智能问答、软件病毒分析等关键问题,于 AlphaFold2 ...
近日,DeepMind 在Nature发表的新论文阐述了 AlphaFold2 的细节,并在 GitHub 公开了源代码,目前已有 4600 左右颗 star。 图| AlphaFold 算法已开源(来源:GitHub) 与此同时,大卫・贝克团队也在Science发表了相关论文,并开源了 RoseTTAFold 的源代码,后者影响力虽然稍逊一筹,但也已经有 890 颗左右 star。
1.收集到大量的蛋白质结构数据，使得AlphaFold2能够拟合更多的数据。2.得益于DeepMind的财力，拥有无与伦...
开源数据科学公司 Zilliz 合伙人、研发总监郭人通告诉 DeepTech,AlphaFold2 的巨大成功预示着我们正在进入一个全新的数据应用时代,这个时代的特点是:以非结构化数据作为数据基础、以 AI 作为计算手段。 图| 郭人通(来源:受访者) 在AlphaFold2 的案例背后,我们可以看到非结构化数据应用的基本模式:其一,对非结构化数据中...
AlphaFold's output for a small number of proteins has high inter-run variance, and may be affected by changes in the input data. The CASP14 target T1064 is a notable example; the large number of SARS-CoV-2-related sequences recently deposited changes its MSA significantly. This variability...
『AlphaFold2开源再引轰动,GitHub 4600颗star!全新数据应用时代或已经到来』OAlphaFold2开源再引轰动,GitHub 4600颗star... AlphaFold2开源再引轰动,GitHub 4600颗star!全新数据应用时代或已经到来 AlphaFold2 开源,或将给细胞生物学领域带来一场革命。 上周,谷歌母公司 Alphabet 旗下的实验室......
DeepMind科学AI负责人Pushmeet Kohli表示,几种AlphaFold3复制品的出现表明,即使没有开源代码,该模型也是可复现的。 他补充说,未来他希望看到更多关于出版规范的讨论,因为这一领域越来越多地由学术界和企业研究人员共同参与。 此前,AlphaFold2的开源推动了其他科学家的大量创新。