protein-structureproteinrepresentation-learningprotein-sequencepredicted-structurespretrainingstructure-awareprotein-language-modelalphafold2foldseekstructural-alphbetprotein-llm UpdatedMar 16, 2025 Python Trainable PyTorch framework for developing protein, RNA and complex models. ...
MD+Alphafold2 https://github.com/pablo-arantes/Making-it-rain Blogs DeepMind: AlphaFold-Using-AI-for-scientific-discovery DeepMind: alphafold-a-solution-to-a-50-year-old-grand-challenge-in-biology DeepMind: putting-the-power-of-alphafold-into-the-worlds-hands References reference papers Reference...
在AlphaFold2 的业务拓展方面,DeepMind 表示它致力于 “大规模” 地提供服务,并与合作伙伴联合探索新领域,例如多种蛋白质如何形成复合物、以及如何与 DNA、RNA 和小分子相互作用。 今年早些时候,该公司宣布与总部位于日内瓦的 “被忽视疾病药物计划”(Drugs for Neglected Diseases initiative)建立合作关系,后者是一个...
在AlphaFold2 的案例背后,我们可以看到非结构化数据应用的基本模式:其一,对非结构化数据中的关键信息进行编码,通过已有的海量数据构建解空间;其二,基于语义匹配,将初始问题转化为对解空间的搜索;三,对搜索结果的拼合等后处理。这一基本模式可帮助人类有效解决内容推荐、智能问答、软件病毒分析等关键问题,于 AlphaFold2 ...
This step requiresaria2cto be installed on your machine. AlphaFold needs multiple genetic (sequence) databases to run: UniRef90, MGnify, BFD, Uniclust30, PDB70, PDB(structures in the mmCIF format). We provide a scriptscripts/download_all_data.shthat can be used to download and set up all...
1.收集到大量的蛋白质结构数据，使得AlphaFold2能够拟合更多的数据。2.得益于DeepMind的财力，拥有无与伦...
开源数据科学公司 Zilliz 合伙人、研发总监郭人通告诉 DeepTech,AlphaFold2 的巨大成功预示着我们正在进入一个全新的数据应用时代,这个时代的特点是:以非结构化数据作为数据基础、以 AI 作为计算手段。 图| 郭人通(来源:受访者) 在AlphaFold2 的案例背后,我们可以看到非结构化数据应用的基本模式:其一,对非结构化数据中...
AlphaFold3源码终于开放了！六个月前，AlphaFold3横空出世震撼了整个学术界。AlphaFold的开发人也凭借它在上个月赢得了诺贝尔化学奖。然而，这个诺奖级AI的「不开源」一直引起学界的不满。谷歌DeepMind只推出了一个免费研究平台「AlphaFold Server」，而且该服务有每日的次数限制。相比于开源的AlphaFold2来说，这种使用方式...
『AlphaFold2开源再引轰动,GitHub 4600颗star!全新数据应用时代或已经到来』OAlphaFold2开源再引轰动,GitHub 4600颗star... AlphaFold2开源再引轰动,GitHub 4600颗star!全新数据应用时代或已经到来 AlphaFold2 开源,或将给细胞生物学领域带来一场革命。 上周,谷歌母公司 Alphabet 旗下的实验室......
DeepMind科学AI负责人Pushmeet Kohli表示,几种AlphaFold3复制品的出现表明,即使没有开源代码,该模型也是可复现的。 他补充说,未来他希望看到更多关于出版规范的讨论,因为这一领域越来越多地由学术界和企业研究人员共同参与。 此前,AlphaFold2的开源推动了其他科学家的大量创新。