近年来，深度学习技术的进步，加上 Protein Data Bank (PDB) 实验蛋白质结构数据的指数级增长，使得蛋白质结构预测领域取得了不少重要突破。其中，最知名的莫过于 AlphaFold2，其使用最新的人工智能算法对蛋白质结构实现了接近实验精度的精准预测，相关成果被 Science 评为 2020 年十大科学突破之一。无独有偶，2021 ...
^alpha fold 开源代码 https://github.com/deepmind/alphafold ^alpha fold colab https://colab.research.google.com/github/deepmind/alphafold/blob/main/notebooks/AlphaFold.ipynb ^torch版alpha fold https://github.com/lucidrains/alphafold2 ^ccmpred github https://github.com/soedinglab/CCMpred ^CCMPred论...
其中,最知名的莫过于 AlphaFold2,其使用最新的人工智能算法对蛋白质结构实现了接近实验精度的精准预测,相关成果被 Science 评为 2020 年十大科学突破之一。 无独有偶,2021 年 7 月,华盛顿大学生物学家 David Baker 团队研发的 RoseTTAFold 构建了一种「三轨 (three-track)」神经网络,能在十几分钟之内解析给定序...
模态的概念是可以延展的，不仅仅是当前的文本、图像和视频这几类模态，像Alpha FOLD生成的蛋白质三维结构，两人对话形式的播客等都可以算是一类模态。我们峰瑞投资的一家公司叫Top view.AI，其目标就是给TikTok或者Instagram的商家制作商业视频，但是它基本上无需人工介入即可完成大部分工作，我们只要提供商品详情页的链...
Bondweight=energy×2×(1−(distancedistancemax)) Each residue's weight in the wild-type and variant proteins is calculated by summing the weight of its bonds. Calculate fold change (FC): In this step, AlphaRING calculates the FC between the weight of the wild-type and variant residue at...
https://github.com/hyperai/awesome-ai4s 蛋白质动态结构预测研究尚存空白 AlphaFolding模型可以被视作结构生物学研究的重要进展。所谓结构生物学,是以蛋白质等生物大分子的结构、运动和相互作用的研究为基础来阐明生命现象的科学, 现已发展成为分子生物学的主流。
github.com/hyperai/awes 蛋白质动态结构预测研究尚存空白 AlphaFolding 模型可以被视作结构生物学研究的重要进展。所谓结构生物学,是以蛋白质等生物大分子的结构、运动和相互作用的研究为基础来阐明生命现象的科学, 现已发展成为分子生物学的主流。 近年来,深度学习技术的进步,加上 Protein Data Bank (PDB) 实验蛋...
https://github.com/hyperai/awesome-ai4s 蛋白质动态结构预测研究尚存空白 AlphaFolding 模型可以被视作结构生物学研究的重要进展。所谓结构生物学,是以蛋白质等生物大分子的结构、运动和相互作用的研究为基础来阐明生命现象的科学, 现已发展成为分子生物学的主流。
conda create -n AlphaTools python=3.10.4 pandas=1.4.2 plotly=5.22.0 matplotlib=3.7.1 numpy=1.26.4 biopython=1.81 requests=2.29.0 -y conda activate AlphaTools The script expects five models per fold folded with AlphaFold3. The input directory should be the unzipped output of an AlphaFold3...
代码: https://github.com/KosinskiLab/AlphaPulldown https://github.com/google-deepmind/alphafold 生物专业入坑教程:Alphafold的原理和展望 钟博子韬 | 钰沐菡 公益公开课 2023年12月09日 我就