通过geom_violin可绘制出小提琴图: ggplot(data2,aes(x=variable,y=value ,fill = variable))+ geom_violin(alpha=0.5,aes(linetype=NA))+ xlab("Group")+ylab("Score")+ theme_bw()+theme(legend.position = "none") 通过geom_jitter组合geom_violin可绘制出抖点+小提琴图: ggplot(data2,aes(x=vari...
p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = 45) + scale_x_discrete(labels = c("0" = "Yes","1" = "No")) + #改x轴label名 geom_violin(trim=FALSE,...
Cloud Studio代码运行 ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0....
aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + geom_point(position = 'jitter', color= 'grey', size= 2, alpha= 0.8) + theme_classic p 2. 中间层——小提琴图叠加 #小提琴图绘制 p1<- p + geom_violin(aes(fill = Species), color= 'grey', scale= 'width', linewidth= 0.8,#外轮廓粗细 tri...
• Key function: geom_violin()• Alternative function: stat_ydensity()• Key arguments to customize the plot: alpha, color, linetype, size and fill.#基础e+ geom_violin()#旋转e+ geom_violin() + coord_flip()#不修剪小提琴的尾部e+ geom_violin(trim = FALSE, fill = "steelblue")加...
ggplot(data=df,aes(x=groups,y=value,fill=type))+geom_violin()+geom_boxplot() image.png 箱线图的宽度有点大,盖住了背后的小提琴图,把宽度设置的小一点,需要加width参数 代码语言:javascript 复制 ggplot(data=df,aes(x=groups,y=value,fill=type))+geom_violin()+geom_boxplot(width=0.3) ...
绘图使用ggplot函数,依次进行:设置数据文件、初始化坐标轴、绘制小提琴图geom_violin、设置x轴标签显示方式、调整图例摆放位置,然后输入p生成plot。 p <- ggplot(long_table,aes(x=Grp,y=Value)) +geom_violin(aes(fill <- factor(Grp))) +theme(axis.text.x=element_text(angle=45,hjust=1,vjust=1)) +...
geom_violin+ facet_grid(rows = vars(cluster), scales = 'free_y') p1 #限定小提琴图宽度,同时显示分位数线: p2<- ggplot(data = dt, aes(x = genes, y = expressions, fill = cluster)) + geom_violin(scale = 'width',#限定每个小提琴图最大宽度相同 ...
geom_boxplot(): 箱线图 geom_violin():小提琴图 geom_dotplot():点图 geom_jitter(): 带状图 geom_line(): 线图 geom_bar(): 条形图 箱线图 e+geom_boxplot() 1. 添加有缺口的箱线图 e+geom_boxplot(notch = TRUE) 1. 按dose分组映射给颜色 e+geom_boxplot(aes(color=dose)) 1. 将dose...
geom_abline(): 我们主要使用两个参数控制线条的位置,slope控制斜率,intercept控制截距,下面是一个简单的例子,我们在散点图层上叠加截距为20,斜率为2的直线: library(ggplot2) p<- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +geom_point()+geom_abline(intercept=20,slope =2) ...