主要分析方法是KM生存曲线。需要注意的是,在GEPIA2021中,选择的免疫细胞不能超过四个,否则无法进行分析。 📚 其他工具推荐 除了GEPIA2021,还有很多其他免疫浸润工具,比如cirbersort、TIMER、ssGSEA、XCell等等。3月12-13号,我们还有免疫浸润的相关培训课程,几乎涵盖了目前常用的所有免疫浸润工具,欢迎大家参加! 🔥 ...
GEPIA目前综合分析TCGA和GTEx数据最好的平台,目前已经更新到2.0版本。前一段时间GEPIA的团队发表了一个对免疫细胞进行相关分析的数据库—GEPIA2021(http://gepia2021.cancer-pku.cn/),GEPIA 2021的功能主要包括:细胞比例分析、关联分析、亚表达分析、生存分析,接下来小编就来给大家具体介绍一下。 GEPIA2021的首页长这...
GEPIA基于TCGA和GTEx数据库的肿瘤与正常样本进行基因表达分析。GEPIA2021是一个独立的扩展,具有针对 GEPIA 的多重去卷积分析,使用生物信息学工具CIBERSORT、EPIC和quantTIseq对TCGA/GTEx中的每个示例工具进行去卷积,并根据每个批量 RNA 样本中推断的细胞比例,我们可以执行多个下游分析。 1。比例分析:可视化使用交互式箱线...
Thus, we present GEPIA2021, a standalone extension of GEPIA, allowing users to perform multiple interactive analysis based on the deconvolution results, including cell type-level proportion comparison, correlation analysis, differential expression, and survival analysis. With GEPIA2021, experimental ...
图1 GEPIA 2021网站入口 图2 GEPIA 2021概括 二.GEPIA 2021功能 1.细胞比例分析 在这一部分网站会提供可视化交互式箱线图展示选择的每个细胞类型的比例。我们可以对细胞类型或TCGA/GTEx子数据集之间的比例进行定量比较(ANOVA),如图3所示我们可以过滤感兴趣的细胞类型,可视化并比较它们在每个样本中的比例。
图1 GEPIA 2021网站入口 image 图2 GEPIA 2021概括 二.GEPIA 2021功能***1.细胞比例分析在这一部分网站会提供可视化交互式箱线图展示选择的每个细胞类型的比例。我们可以对细胞类型或TCGA/GTEx子数据集之间的比例进行定量比较(ANOVA),如图3所示我们可以过滤感兴趣的细胞类型,可视化并比较它们在每个样本中的比例。 im...
gepia2021可以做免疫浸润生存分析了 PhageNanoenzyme关注赞赏支持gepia2021可以做免疫浸润生存分析了 PhageNanoenzyme关注IP属地: 河南 0.122021.09.18 16:53:08字数0阅读635 image.png image.png http://gepia2021.cancer-pku.cn/survival.html©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者 1人点赞 日记本 ...
2021H1中国智能制造行业发展特点分析 自动化、人工智能和传统产业,尤其是制造业的结合将是未来企业提升用工效率和竞争力的重要要素。 制造流程智能化 智能制造行业在生产的各个方面全方位地推动制造业智慧化转型,包括连接消费者和制造商、连接产品和设备等的智能连接服务,RFID等智能产品、提供质量监测和机台数据监测等...
GEPIA2021的首页长这样: 数据库具体使用 1. 免疫细胞比例分析 在这个部分,我们可以分析不同的组织当中免疫细胞比例。我们需要做的就是选择想要分析的组织已经想要分子的免疫细胞即可。 例如我们想要分析在膀胱癌当中基于CIBERSORT算法得到的两种B细胞的变化。