scRNA-seq 非常适合研究细胞群的异质性。例如,识别组织的细胞类型,定义不同细胞类型的"转录指纹",研究细胞分化,探索疾病或环境因素导致的细胞组成变化等。 单细胞测序的经典流程:分离单细胞(核),将RNA转换为cDNA,准备测序文库(illumina)后测序。 SMART-seq2是一种低通量单细胞测序法,提供全长转录组的定量,适合研究...
scRNA-seq方法还允许根据单细胞的转录组对单个细胞进行聚类,从而可以检测罕见的细胞类型以及细胞群如何随时间变化或对药物的反应。 scRNA-seq的基本工作流程是将细胞群分离成单个细胞,分离其mRNA,通过逆转录生成标记的cDNA,制备测序文库,然后进行标准的短读长测序。随着人们对scRNA-seq的兴趣日益浓厚,已经开发了多种技术...
scRNA-seq)是在单个细胞水平进行转录组学分析的技术。在单个细胞的分辨率下,科学家能真正的定义细胞类型...
10x Genomics是一家生物技术公司,他们利用一种被称为GEM(Gel Bead-in-EMulsion)技术的方法,结合了微流控和核酸测序技术,开发了一种商业化的scrna-seq解决方案。 scrna-seq 10x Genomics的原理主要包括以下几个步骤: 1.细胞悬浮:将细胞样品进行消化、机械分散等处理,得到单个细胞悬浮液。这一步骤的目的是确保每个...
小果今天介绍单细胞测序平台中最受欢迎的10×genomics的原理。 单细胞测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单个细胞水平进行转录组学分析的技术。在单个细胞的分辨率下,科学家能真正的定义细胞类型特定的基因表达,分辨出细胞的异质性。这是过去RNA-seq所无法企及的。
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 10x Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优势,一个样品...
但目前的scRNA-seq由于采用短读长测序,一般仅被用于实现单细胞水平的基因表达定量。而将10x Genomics的高通量单细胞捕获平台与常规的Iso-Seq结合,实现两种技术的优势互补,无疑是最佳的解决方案。 技术原理 贝瑞基因推出单细胞水平和全长转录本兼得的转录组研究利器—10x scIso-Seq,将10x Genomics单细胞转录组测序与...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
事实上,单细胞实验的上游工作与实验本身同样重要。熟练的样本制备将是实验成功的关键决定因素,它能够产生高质量的单细胞或单细胞核悬液。 单细胞RNA测序(scRNA-seq)以及基于单细胞或单细胞核的其他测序方法(比如免疫分析或染色质可及性分析)都是功能强大的方法,让研究人员能够逐个细胞地探索基因表达动态、基因调控、抗...
实验技术:scRNA-seq 研究结果 从新鲜组织中鉴定出的肿瘤异质性在冻存重复样本中很大程度上是保守的。研究发现,从冻存组织片段或冻存细胞悬液制备的单细胞测序与从新鲜组织制备的测序细胞相当,冻存细胞悬液在基因表达方面与新鲜组织显示出更高的相关性。结果表明,冻存对下游分析(如生物通路富集)的结果影响极小。对于...