然而，其中最受瞩目的当属单细胞转录组测序（scRNA-seq），即单细胞RNA测序技术。这项技术的兴起，不仅...
scRNA-seq方法还允许根据单细胞的转录组对单个细胞进行聚类,从而可以检测罕见的细胞类型以及细胞群如何随时间变化或对药物的反应。 scRNA-seq的基本工作流程是将细胞群分离成单个细胞,分离其mRNA,通过逆转录生成标记的cDNA,制备测序文库,然后进行标准的短读长测序。随着人们对scRNA-seq的兴趣日益浓厚,已经开发了多种技术...
单细胞测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单个细胞水平进行转录组学分析的技术。在单个细胞的分辨率下,科学家能真正的定义细胞类型特定的基因表达,分辨出细胞的异质性。这是过去RNA-seq所无法企及的。 在众多的单细胞测序平台中,10×genomics最受欢迎表现最亮眼。其采用了基于微滴的微流体技术来分选细...
scRNA-seq 非常适合研究细胞群的异质性。例如,识别组织的细胞类型,定义不同细胞类型的"转录指纹",研究细胞分化,探索疾病或环境因素导致的细胞组成变化等。 单细胞测序的经典流程:分离单细胞(核),将RNA转换为cDNA,准备测序文库(illumina)后测序。 SMART-seq2是一种低通量单细胞测序法,提供全长转录组的定量,适合研究...
scrna-seq 10x Genomics的原理主要包括以下几个步骤: 1.细胞悬浮:将细胞样品进行消化、机械分散等处理,得到单个细胞悬浮液。这一步骤的目的是确保每个细胞独立存在,以便后续的分析。 2.胶滴合成:将单个细胞与一组含有特殊的条码分子的胶滴(GEMs)相结合。GEMs是由微流控技术和油水分离技术生成的微型反应室,每个胶滴...
小果今天介绍单细胞测序平台中最受欢迎的10×genomics的原理。 单细胞测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单个细胞水平进行转录组学分析的技术。在单个细胞的分辨率下,科学家能真正的定义细胞类型特定的基因表达,分辨出细胞的异质性。这是过去RNA-seq所无法企及的。
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 10x Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优势,一个样品...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)已成为探索复杂人类癌症中细胞异质性的有力工具。使用新鲜人类手术组织的scRNA-seq研究在逻辑上是困难的,排除了样本的组织病理学分诊,并限制了进行批处理的能力。这种阻碍往往会在整合患者数据集时引入技术偏倚,增加实验成本。尽管之前已经探索了组织保存方法来解决这类问题,但它尚待在...
来自PCa成纤维细胞的scRNA-seq数据显示,基于独特的胶原蛋白库和其他细胞外基质(ECM)分子的表达,有五种不同的细胞类型。 细胞外基质组织(ECM)途径是PDGFRA+和POSTN+CTHRC1+FAP+ Fibro最常见途径,通过分析表明FAP和/或PDGFRA激活的成纤维细胞可能是不同情况下肿瘤微环境重塑的结果。