GUIDE ╲ 肿瘤药物敏感性基因组学数据库(Genomics of Drug Sensitibity in Cancer,GDSC)由英国桑格研究院开发,收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应数据。癌基因组的变异会影响临床治疗的效果,不同的靶点对药物的反应也有很大不同。因此这类数据对于发现潜在的肿瘤治疗靶点十分重要。 数据库介绍 2019年7月更新后的GDSC...
在第一期的GDSC数据总览中,我们根据数据库的模块进行总体的介绍。今天我们再深入了解GDSC所包含的数据及其获取的方法,也就是GDSC的数据下载模块。 GDSC数据下载的模块,分为4个模块,分别是ANOVA results、drug data、genetic features和bulk data。在分析中常用药物筛查IC50数据和多组学数据,故核心下载部分为bulk data。
在第一期的GDSC数据总览中,我们根据数据库的模块进行总体的介绍。今天我们再深入了解GDSC所包含的数据及其获取的方法,也就是GDSC的数据下载模块。 GDSC数据下载的模块,分为4个模块,分别是ANOVA results、drug data、genetic features和bulk data。在分析中常用...
[2] Yang, W., et al., Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC): a resource for therapeutic biomarker discovery in cancer cells. Nucleic Acids Res, 2013. 41(Database issue): p. D955-61. [3] Roy, R., et al., Expression Levels of ...
📖参考文献:Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC): a resource for therapeutic biomarker discovery in cancer cells. Wanjuan Yang, Jorge Soares, Patricia Greninger, Elena J. Edelman, Howard Lightfoot, Simon Forbes, Nidhi Bindal, Dave Beare, James A. Smith, I. Richard Thompson. (Nucl....
肿瘤药敏数据库 1 GDSC数据库 公众号：生信小课堂 抗癌药物敏感性基因组学（GDSC， Genomics of Drug Sensitivity in Cancer） 由英国桑格研究院开发，收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应。是目前肿瘤细胞药物敏感性的最大公共资源。2020年6月跟新到了8.3 version GDSC中收录的518个抗癌化合物的作用广泛，涉及24种...
GDSC有两种主要含义:一是指全球数字技能锦标赛(Global Digital Skills Competition),二是指癌症药物敏感性基因组学数据库(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)。以下分领域具体说明。 一、全球数字技能锦标赛(GDSC) 基本信息 全球数字技能锦标赛(GDSC2024)是第三届国际性赛事,聚焦数字技能领域,202...
药物敏感性是癌症治疗领域的重要研究方向。基因组学的进步使得我们可以通过分析基因表达与药物反应之间的关系,从而更好地预测患者对特定药物的反应。GDSC(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)是一个大型数据库,提供了多种癌症细胞系对不同药物的敏感性数据以及对应的基因组信息。本文将详细介绍如何利用GDSC数据库,分...
GDSC药敏分析R语言,#GDSC药敏分析R语言##1.引言GDSC(GenomicsofDrugSensitivityinCancer)药敏分析是一种用于研究肿瘤细胞对抗癌药物的敏感性的方法。通过分析大规模的肿瘤细胞系的基因组数据和药物治疗的敏感性数据,可以发现肿瘤细胞中的药物靶点和抗药机制,从而指导临
DataBase肿瘤药物敏感性基因组学数据库GDSC DataBase肿瘤药物敏感性基因组学数据库GDSC https://www.cancerrxgene.org/ Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC)，提供免费公开的肿瘤治疗基因组数据，致⼒于发现潜在的肿瘤治疗靶点以改善肿瘤治疗，是全球最⼤的同类型公共数据库。⾸页可见，GDSC数据库⽀...