fsl reg命令是FSL(FMRIB Software Library)中的一个命令行工具,用于进行图像配准。 什么是图像配准? 图像配准是将不同空间的多幅图像进行比较或整合的过程。在医学影像领域,图像配准常用于将多幅不同扫描序列下的同一病人的脑部扫描图像进行对齐,以便更好地评估器官形态和对比度的变化。 如何使用fsl reg命令? fsl ...
此函数调用parameter,用于将EPI图像(通常是函数或扩散)注册到结构(例如T1加权)图像。 语法\用法: fslepi_reg(epi, t1, t1_brain, outfile = NULL, retimg = TRUE, reorient = FALSE, intern = FALSE, fmap = NULL, fmap_mag = NULL, fmap_mag_brain = NULL, echo_spacing = NA, phase_enc_dir =...
MNI152_TI_1mm_Brain_Mask.nii.gz T1就是指TIw,1mm是说间距1mm,Brain是 skull stripped去掉了脑壳的,Mask就是掩膜图片 output images就复制input images的名字加个_reg就行了 具体参数的选择如下: search选项 已经配准了不需要寻找 没有配准,但是有相同的方向 方向也不相同 可能就是配准时的空间变换范围,如果两...
一(转换到Nifti格式):可以使用dcm2niix工具进行无损转换,同时也可以自订输出文件的格式以应对不同的处理工具。该工具可在如下网站找到:https://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage 也可以使用常用的MRIcroGL工具进行这一步,可在以下网址找到:https://www.nitrc.org/projects/mricrogl/...
本来就有个要扔在app data的roming里边,然后主要是有个P3D add on的文件最大,那个要看你的“我的文档”是不是在C盘,有的装机系统会把这个文件夹挪去D盘,那就得扔去D盘这个文件夹。扔好以后把那几个reg右键“编辑”打开,看看里边带计算机用户名的地方是不是你电脑用户名,nav那个是必须一致的,飞机那几个有...
下一步就是tbss_2_reg, 决定了对齐的成败与否,有两种可能的方法。最准确的方法是把每个被试的图像与其他被试的图像进行一一对齐,然后选出整个数据中最有代表性的图像,其他的图像都与它对齐。这个方法需要数天的时间(12人数据量)。第二种方法就是实现指定一张目标图像,然后把其他的所有的图像都与它对齐,这个方法...
reg = <0x0 0x100>; interrupts = < 37 2 0 0 /* msg1_tx_irq */ 38 2 0 0>;/* msg1_rx_irq */ }; message-unit@100 { compatible = "fsl,srio-msg-unit"; reg = <0x100 0x100>; interrupts = < 39 2 0 0 /* msg2_tx_irq */ 40 2 0 0>;/* msg2_rx_irq */ }; do...
要检查FIX是否正确地移除了伪影成分(即它是否做了你想用fsl_regfilt做的)你可以检查 在fix4melview….txt文件中的FIX的分类并调整训练数据集,调整你用作appropriate的阈值。 3.4 Can I use FIX to clean task fMRI data? Yes, although you will probably need to create a study-specific training dataset ...
2= C:/users/yourusername/ Run both provided .reg files Edit A320 navdata.reg with your windows...
fsl_regfilt- command-line tool for removing regressors from data (melodic denoising) 1.2 Melodic GUI 要调用 MELODIC GUI,请在终端中键入MELODIC(在 Mac 上键入Melodic_gui),或运行fsl并按下MELODIC按钮。 在调用 GUI 之前,您需要将每个会话的数据准备为 4D NIFTI 或分析格式图像; ...