-smallOk添加该选项时,如果fastq文件reads数小于抽取的reads数,则输出整个输入的fastq。 -json添加该选项时,<out.stats> 将转为json格式。 对于不想输出的结果文件,可以使用/dev/null进行占位。 $ ./fastqStatsAndSubsample fastqStatsAndSubsample v2 - Go through a fastq file doing sanity checks and collecting...
安装和使用fastqStatsAndSubsample时，可以直接引用编译好的文档。例如，如果你想统计fastq文件SRR12495872_R1.fastq的质量，只需运行相应的命令。抽样功能默认抽取100,000条数据，但需要确保fastq文件已单独压缩，不能直接通过.gz后缀获取压缩文件。默认情况下，工具以文本格式输出，如果需要json格式结果，可以...
UCSC工具fastqStatsAndSubsample是一款专为fastq文件质量统计与抽样设计的实用工具。其主要功能包括对fastq文件进行全面的统计分析，包括计数reads和碱基数，以及对随机抽样的数据进行同样处理。此外，它还能提供详细的统计信息，如碱基长度的平均值、标准差、范围，以及碱基质量的平均值、变异度等，同时展示atcgn...