今天我把所有的流程整理好了,eQTL数据使用的是最广泛的eQTLGen的数据,由于官网的数据被切割成了cis和trans,我就使用了IEU数据库的VCF文件,下载方式如图: GWAS数据使用的是芬兰的数据,下载方式可参考:孟德尔随机化必备数据——芬兰数据库FinnGen R9数据下载。 下载的数据均无需解压,放在工作目录即可。代码是傻瓜式的,...
本文聚焦于使用eQTLGen的eQTL数据与FinnGen的GWAS数据进行coloc共定位分析的方法。coloc共定位分析原理相对直截了当,关键在于运用coloc.abf函数,数据整理成该函数所需的格式。整理数据成所需格式是整个流程中的核心步骤,包括整理成list形式,这是至关重要的一步。对于初学者来说,理解数据参数的计算和处理...
我就不能再等别人了……这份友情来的不容易,我不是非要等你:好吗,只是等了你。所以让我们好好珍惜 û收藏 3 2 ñ赞 还没有人评论,赶快抢个沙发相关推荐 e刷新 +关注 成都青白江 07月24日 08:42 #花木兰再次撤档#迪士尼真人电影《花木兰》再次宣布撤档,此前北美定档8月21...