不了解的该数据库的小伙伴们可以查看eQTLGen Consortium数据库简介(1)。 1)官方网址 https://www.eqtlgen.org/ 2)相关基因的cis-eQTLs查找(例如acly): 目前我们只关注cis-eQTL,因为cis-eQTL对相关基因表达更强;而trans-eQTLt由于过于复杂,这里我们不进行讨论。 3)Cis-eQTLs的选择 尽量选择: ·P值较小 · Z...
eQTLGen Consortium主要是,基于血液基因表达,通整体基因水平的Meta分析(meta-analyses),得到eQTL 的大型数据库(不知道eQTL的同学,点击这里eQTL, cis-eQTL, trans-eQTL介绍和获取)。 数据库概况: 官方网址[2]:eqtlgen.org/; 数据来源:来源于Consortium members; 数据分类:37 个数据集 (包括cis-eQTL, trans-eQTL, ...
Single-cell eQTLGen Consortium: a personalized understanding of diseaseMonique Van Der WijstDylan De VriesHilde GrootLude Franke
The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues - Science 11 Sep 2020: Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues - Science 11 Sep 2020: 新鲜出炉的文章,测了各种cell type的数据,根据统计学的deconvolution方法,鉴定出来了更多的eQTL。 大部...
The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues - Science 11 Sep 2020: Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues - Science 11 Sep 2020: 新鲜出炉的文章,测了各种cell type的数据,根据统计学的deconvolution方法,鉴定出来了更多的eQTL。
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The single-cell eQTLGen consortium - PubMedpubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32149610/ 单细胞eqtlGene, 有空看下怎么挖掘数据和使用。发布于 2023-06-01 18:51・IP 属地吉林 内容所属专栏 单细胞转录组 单细胞转录组测序及数据分析全流程分享 订阅专栏 ...
The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues - Science 11 Sep 2020: Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues - Science 11 Sep 2020: 新鲜出炉的文章,测了各种cell type的数据,根据统计学的deconvolution方法,鉴定出来了更多的eQTL。