1、可用药基因的搜索 2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量（eqtl）筛选阳性结果的可用药基因 4、利用共定位进一步批量筛选可用药基因 5、pqtl数据进行验证 创新补充：SMR mQTL分析 什么是mQTL？mQTL：DNA甲基化数量性状位点，也就是理解为调控DNA甲基化水平的SNP。DNA甲基化数据（mQTL）下载 提取靶点基...
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这篇范文的思路是eQTL筛选、共定位进一步筛选、pQTL验证,如果我们觉得深度不够或者工作量不够,我们还添加SMR分析、mQTL分析,SMR之前是分享过了,现在重点是来讲解一下mQTL的思路。 1、可用药基因的搜索 2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量(eqtl)筛选阳性结果的可用药基因 4、利用共定位进一步批量筛选可...
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eQTL、共定位、pQTL、SMR、mQTL(甲基化)大数据联合分析思路( 高分SCI), 视频播放量 2409、弹幕量 1、点赞数 34、投硬币枚数 7、收藏人数 94、转发人数 11, 视频作者 生信狂人团队, 作者简介 医学生信、孟德尔随机化分析课程培训、答疑指导!,相关视频:DNA甲基化位点与基因
06.提取甲基化位点数据【DNA甲基化位点(mQTL)孟德尔随机化(MR)分析】 598 0 13:47 App 01.课程简介【115.多组学eQTL/pQTL 孟德尔随机化、SMR 与共定位分析实战】 130 0 02:07 App 17.共定位分析【乳酸化多组学(eQTL/pQTL/SMR)GEO孟德尔随机化】 ...
pQTL批量MR分析 上述阳性结果取交集 补充验证:共定位 补充验证:SMR分析 导师或者主任下达的任务完成:候选基因:NT5E、CSTB上述分析流程工作量是非常大的,特别是在数据整理这块,需要大量的时间和精力,普通电脑基本处理不了这些大数据,如果用别人过滤好的数据就可以直接用普通电脑分析了,这样就非常方便。本文只分享思路和步...
根据影响性状的不同,QTL又可以分为以下种类: eQTL:表达量性状位点 pQTL:蛋白质数量性状位点 mQTL:甲基化数量性状位点 sQTL:剪切数量性状…阅读全文 赞同25 3 条评论 分享收藏 很多领域的研究用到的分子生物学的QTL(数量性状位点)定位其基本原理和算法是什么呢? Philip Yang 生物学话题...
gene-expression methylation qtl eqtl mqtl qtl-analyses Updated Apr 22, 2024 Shell Genome3d / genetic_regulation_in_ASD Star 6 Code Issues Pull requests Analysis of regulatory impacts of autism-associated SNPs on biological pathways in the fetal and adult cortex. snps gene-regulation gwas-catal...