eQTL、共定位、pQTL、SMR、mQTL(甲基化)大数据联合分析思路( 高分SCI), 视频播放量 2409、弹幕量 1、点赞数 34、投硬币枚数 7、收藏人数 94、转发人数 11, 视频作者 生信狂人团队, 作者简介 医学生信、孟德尔随机化分析课程培训、答疑指导!,相关视频:DNA甲基化位点与基因
Using summary-data-based Mendelian randomization, CYP21A2, CCND1, PSMA4, and MED1 were identified as potential gene targets, with MED1 further validated through pQTL and mQTL data. Additionally, the MED1 protein was found to bind spontaneously with astragalin, fenofibrate, and ginsenoside.The ...
2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量(eqtl)筛选阳性结果的可用药基因 4、利用共定位进一步批量筛选可用药基因 5、pqtl数据进行验证 创新补充:SMR mQTL分析 什么是mQTL?mQTL:DNA甲基化数量性状位点,也就是理解为调控DNA甲基化水平的SNP。DNA甲基化数据(mQTL)下载 提取靶点基因甲基化位点数据 靶点...
这篇范文的思路是eQTL筛选、共定位进一步筛选、pQTL验证,如果我们觉得深度不够或者工作量不够,我们还添加SMR分析、mQTL分析,SMR之前是分享过了,现在重点是来讲解一下mQTL的思路。 1、可用药基因的搜索 2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量(eqtl)筛选阳性结果的可用药基因...
DNA甲基化数据(mQTL)下载 提取靶点基因甲基化位点数据 靶点基因甲基化位点数据的过滤 靶点基因甲基化位点批量MR分析 从而得到与结局相关联的靶点基因甲基化位点,这将有助于我们理解靶点基因调控机制及其对于复杂性状的影响。 本文只分享eQTL、共定位、pQTL、SMR、mQTL(甲基化)联合分析思路,剩下的细节问题需要自己的探索...
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