2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量（eqtl）筛选阳性结果的可用药基因 4、利用共定位进一步批量筛选可用药基因 5、pqtl数据进行验证 创新补充：SMR mQTL分析 什么是mQTL？mQTL：DNA甲基化数量性状位点，也就是理解为调控DNA甲基化水平的SNP。DNA甲基化数据（mQTL）下载 提取靶点基因甲基化位点数据 靶点...
westra_eqtl_hg19为eQTL数据,该数据通过westra_eqtl_hg19.zip解压得到 mygwas为生成的共定位结果文件名 eQTL共定位结果(以westra_eqtl_hg19数据为例): 每一列代表的意思:Columns are probe ID, probe chromosome, gene name, probe position, tans-eQTL chromosome, left boundary of the trans-region, right boun...
eQTL、共定位、pQTL、SMR、mQTL(甲基化)大数据联合分析思路( 高分SCI), 视频播放量 2332、弹幕量 1、点赞数 33、投硬币枚数 7、收藏人数 92、转发人数 11, 视频作者 生信狂人团队, 作者简介 医学生信、孟德尔随机化分析课程培训、答疑指导!,相关视频:打通eQTL、pQTL的上
Multi-omics MR analysis showed that the SNP signals associated with ATG10 and RCCD1 were significant across the data from BC Genome-wide association study (GWAS), eQTL, and mQTL studies. In conclusion, we identified two priority genes that are potentially associated with BC. These findings ...
PP153 Characterizing the relationship between DNA-methylation quantitative trait loci (mQTL), expression quantitative trait loci (eQTL), and breast cancer ... PJ Ho,J Li - 《Esmo Open》 被引量: 0发表: 2023年 Metabolomics: Creating new potentials for unraveling the mechanisms in response to ...
这篇范文的思路是eQTL筛选、共定位进一步筛选、pQTL验证,如果我们觉得深度不够或者工作量不够,我们还添加SMR分析、mQTL分析,SMR之前是分享过了,现在重点是来讲解一下mQTL的思路。 1、可用药基因的搜索 2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量(eqtl)筛选阳性结果的可用药基因...
eQTL、mQTL共定位分析属于Post-GWAS的一项重要工作,旨在GWAS结果的基础上鉴定与表型相关的eQTL和mQTL位点。 传统的GWAS是将全基因组范围内的常见变异进行关联分析,鉴定与表型相关的基因座,但鉴定出来的位点大多数位于基因间隔区,其如何通过基因或者通路影响表型很难被阐述。
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