无意间发现seurat中的Dotplot画图时候,不管是在seurat的v4 还是v5版本。都存在这个“bug”:右边本该出现的Averageexpression图注消失了,如何把它恢复呢? 正常的样子,右边是有图注的 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 DotPlot(pbmc,features=c("CD3E",'C1QA','GZMK'),cols=c("red3","green...
2015年时,Satija 和他在剑桥麻省理工Broad研究所的同事(还包括他的博士后导师 Aviv Regev)发布了第一版的 Seurat 软件工具包,2023年3月发布了Seurat v5版本,为单细胞数据分析提供了强有力的工具。 三、Dotplot实战 Dotplot practice 可调控参数展示: install.packages('Seurat')library(Seurat)#相关可调整参数展示...
Seurat V5升级:sketch-based分析后DotPlot图报错解决 最近在研究seurat v5的数据处理。测试的时候发现使用seurat v5包对大数据进行sketch-based抽样分析之后,后续使用DotPLit进行绘图的时候会报错: DotPlot(object=obj,features="Cd79a")dev.off() 报错信息 通过查看源码发现是在这一步出现了问题: DotPlot函数源码部分...
2015年时,Satija 和他在剑桥麻省理工Broad研究所的同事(还包括他的博士后导师 Aviv Regev)发布了第一版的 Seurat 软件工具包,2023年3月发布了Seurat v5版本,为单细胞数据分析提供了强有力的工具。 三、Dotplot实战 Dotplot practice 可调控参数展示: install.packages('Seurat') library(Seurat) #相关可调整参数展...