de novo peptide sequencing algorithms的原理De novo peptide sequencing 指的是从原始蛋白质混合物中从头测序肽段的过程。这个过程主要包括以下几个步骤: 1. 蛋白质消化:首先,将蛋白质样品酶解成小肽段。这一步通常使用蛋白酶(如胰蛋白酶、胃蛋白酶等)来将蛋白质分解成肽段。 2. 肽段分离:消化后的混合物中...
图2. 充分利用de novo测序 的标准PEAKS Studio工作流程 参考文献 1.Tran NH, Qiao R, Xin L, Chen X, Liu C, Zhang X, Shan B, Ghodsi A, Li M. Deep learning enablesde novopeptide sequencing from data-independent-acquisition mass spectrometry. Nature Methods. 16(1), 63-66. 20/12/2018. 2...
[名词解释] De novo sequencing(从头测序) 相关知识点: 试题来源: 解析 unknow peptide从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息,直接解读串联质谱数据的方法。其基本算法主要由4个部分组成:质谱图的构建、离子类型的确定、测序算法以及打分算法。
必应词典为您提供de-novo-peptide-Sequencing的释义,网络释义: 多肽从头测序;测序;
When using pairs of spectra for de novo peptide sequencing, the most popular methods are designed for CID (or HCD) and ECD (or ETD) spectra because of the complementarity between them. Less attention has been paid to the use of CID and HCD spectra pairs. In this study, a new de novo...
Computationally instrument-resolution-independent de novo peptide sequencing for high-resolution devices ...
一、概述 由于难以获得100%的蛋白氨基酸序列覆盖率,蛋白组de novo测序成为了蛋白测序的难点,由Ac-LysargiNase(N端蛋白酶)和胰蛋白酶构成的镜像酶组合可以解决这个问题并具有稳定性,这2种消化位点互补的酶能够产生目标蛋白的镜像b,y离子,基于镜像原理设计的算法pNovoM
本研究采用首次采用de novo转录组组装方法组装了产黑色素短梗霉转录组,并通过转录组对产黑色素短梗霉PMLA生物合成机理进行了探究,本研究结果为进一步研究和利用产黑色素短梗霉菌种提供思路。 第一作者 王舸楠:博士研究生,专业为轻工技术与工程,主要研究内容为基因组、转录组组装、注释及分析;生物信息;机器学习;丝状...
De novo peptide sequencingHybrid peptide sequencingMS validationMS evidenceFunctional annotationHigh resolution mass spectrometry has revolutionized proteomics over the past decade, resulting in tremendous amounts of data in the form of mass spectra, being generated in a relatively short span of time. ...
本研究采用首次采用de novo转录组组装方法组装了产黑色素短梗霉转录组,并通过转录组对产黑色素短梗霉PMLA生物合成机理进行了探究,本研究结果为进一步研究和利用产黑色素短梗霉菌种提供思路。 第一作者 王舸楠:博士研究生,专业为轻工...