DAP-seq技术能够高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点,鉴定下游靶基因。蓝景科信可为您提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析,具有100多个物种,1000多个转录因子的实验经验。我们的DAP-seq技术服务,已助力许多科研院所及高校的客户成功发表文章。 实验流程: 【动画视频】DNA亲和纯化测序(DAP-seq)...
H3K4me3 ChIP-seq是一种用于研究组蛋白甲基化的技术。它专注于组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰,这是基因激活的重要标志。 H3K4me3 ChIP-seq的优势高通量检测: 这项技术能够高通量地检测基因组上的H3K4甲基化修饰,为研究者提供了丰富的数据。跨物种应用: 它的抗体已经完全商业化,可以用于多个物种的检测。多年实验...
这说明在种子发育过程中VvERF98是VvMADS28上游的一个转录调控因子,且可以响应乙烯信号。 图4. DAP-seq分析葡萄VvMADS28的结合基序及其潜在靶基因 采用DAP-seq技术鉴定了VvMADS28最显著富集的结合基序为CArG [序列是CC(A/T)6/8GG],并筛选到4个与胚珠发育相关的潜在靶基因(WUSCHEL-related homeobox 1、HAIKU、DA...
2024年1月25日,南京农业大学白菜系统生物学实验室的研究成果发表在Plant Physiology期刊上(影响因子7.4),题目为“ETHYLENE RESPONSE FACTOR 070 inhibits flowering in Pak-choi byindirectly impairingBcLEAFYexpression”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了小白菜中BcERF070的下游靶基因,揭示了BcERF070响应...
该研究揭示了OsCCA1调控水稻适应盐胁迫、干旱胁迫以及渗透胁迫的分子机制。其中,该研究使用了DNA亲和纯化测序技术(DAP-seq,DNA Affinity Purification Sequencing),鉴定了水稻生物钟核心组分OsCCA1(Oryza sativa CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1)调控的下游靶基因。
采用DAP-seq技术分别鉴定了PtoWRKY68hap1和PtoWRKY68hap2的核心结合基序W1-box和W2-box及其靶点。KEGG分析发现靶基因主要富集于防御反应和植物激素信号通路中。基于DEGs、共表达网络分析和DAP-seq分析,筛选到3个与PtoWRKY68等位基因相关的靶基因:PtoABF2.1、PtoRD26.1、PtoDTX49.1。干旱胁迫下与在PtoWRKY68hap2材料...
图1. 通过DAP-seq技术鉴定GhBES1.4的直接靶基因 图2. GhBES1.4的结合基序分析 通过DAP-seq、RNA-seq和GWAS联合分析,筛选到7个BR调控的纤维伸长相关基因,并进一步解析了GhBES1.4调控棉纤维发育的信号网络。而且,GhHMG1和GhCYP84A1对纤维伸长的促进作用证实了多组学联合分析鉴定基因的准确性。总之,该研究明确了GhB...
应用DAP-seq技术鉴定百脉根中一个NAC转录因子在全基因上的靶基因,揭示硝酸盐诱导根瘤衰老的新机制 豆科植物通过与根瘤菌共生,形成能够固氮的根瘤。硝酸盐能够影响根瘤共生的过程,适宜...2023-04-11 DAP-seq技术鉴定全基因组水平上的ZjVND7靶基因,揭示酸枣全基因组复制在调节木质部导管分化和耐旱性中的作用 ...
DAP-Seq是研究非模式植物顺反组和表观组的有力技术。本实验室先后对水稻,小麦,玉米,苜蓿,大豆,百脉根、香蕉、毛果杨、胡杨等物种开展了实验,建立了标准的实验流程,具有18个家族,100多个转录因子的实战经验。 DAP-seq技术大大扩展和加深了科学家们研究的转录因子结合位点信息。我们的系统廉价并且可以扩展。它能够捕获...