相较于Chip-seq,DAP-seq技术最大的优点在于采用体外表达标签蛋白,将表达产物与目标基因组序列进行结合,完美回避了非模式生物长期面临的缺少蛋白抗体的窘境。 基迪奥的DAP-seq产品在行业内具有丰富的项目经验,项目数已达1000+,并有很多高分客户文章已经见刊。下面分享一些2024年的基迪奥DAP-seq项目文章案例,研究物种包含...
2)DAP-seq研究:利用DAP-seq分析结果,获得上游转录调控因子信息。 3)转录组 + DAP-seq关联:探究目标转录因子对差异基因的调控网络关系,可进一步提升研究深度。通过转录组和DAP-seq分析结果关联,可以获得目标蛋白在全基因组水平上的结合热点(peak 区域),以及实验前后样本转录水平的变化值(差异表达基因),再通过联合定义...
DAP-Seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,所以DAP-Seq具有快速、高通量、节约时间成本等优势,比Chip-seq更易于扩展;DAP-Seq方法可用于大部分的植物,这为科学家提供了一扇窗口,了解调控序列中的遗传或表观遗传变异影响它们性状的机制。 本研究为了检验DAP-Seq技术,科...
然后通过文献案例带大家了解了DAP-seq技术的应用，可以发现DAP-seq技术不仅可以用于单个转录因子结合位点的鉴定还可以用于同源二聚体、异源二聚体或异源四聚体的结合位点鉴定。最后对目前常用的鉴定转录因子结合位点的三种技术（ChIP-seq、CUT&Tag、DAP-seq）的优缺点和适用范围进行了比较，希望可以给大家选择合适的转录...
突破传统:H3K4me3 ChIP-seq技术在表观遗传学中的应用/DNA亲和纯化测序/组蛋白甲基化/特异性抗体/互作组/表观组/甲基化检测/赖氨酸甲基/ 1271 -- 48:30 App 【具身论文阅读】Diffuser: 基于diffusion的强化学习规划器 49 -- 0:26 App H3K4me3 ChIP-seq:汇智生物的精准科研服务/DNA /生物 /实验 /sci论文 /...
DNA亲和纯化测序(DNA Affinity Purification sequencing,DAP-seq)方法,成功将体内结合实验转移到体外,解决了ChIP抗体制备的困扰,极大的提高转录因子结合位点(TFBS)发现的效率。。
总结:该研究首次将DAP-seq技术应用于药用真菌的研究,为基因及分子间相互作用研究提供了新的技术借鉴。该研究揭示了PuCRZ1-钙调神经磷酸酶信号通路在猪苓菌丝体生长以及渗透胁迫耐受中起重要作用,填补了国际上对猪苓CRZ1以及含FYVE结构域蛋白功能研究的空白,也为深入开展猪苓菌核形成机制的研究提供了理论依据。
采用DAP-seq技术分别鉴定了PtoWRKY68hap1和PtoWRKY68hap2的核心结合基序W1-box和W2-box及其靶点。KEGG分析发现靶基因主要富集于防御反应和植物激素信号通路中。基于DEGs、共表达网络分析和DAP-seq分析,筛选到3个与PtoWRKY68等位基因相关的靶基因:PtoABF2.1、PtoRD26.1、PtoDTX49.1。干旱胁迫下与在PtoWRKY68hap2材料...
DAP-seq技术应用广泛，不仅适用于单个转录因子的结合位点鉴定，还能研究同源二聚体、异源二聚体或异源四聚体的DNA结合特异性。麦胚无细胞蛋白表达系统是DAP-seq技术中常用的体外蛋白表达方法，它具有蛋白表达快速准确、不受细胞生长代谢影响等优点。通过这种方式，科学家们能够高效地在体外合成复杂的真核蛋白...