ChIP-seq/DAP-seq/CUT&Tag的原理都可以归纳为目标蛋白在基因组某个位点结合后,含有该位点的DNA片段将会被选择性富集;测序之后,来自于此DNA片段的reads较其他非蛋白结合的DNA片段reads多,在数据可视化上呈现一个堆集起来的山峰(在计算机概念上叫“peak”)。ATAC-seq的原理则是利用Tn5转座酶特异性识别染色质开放区并...
ChIP-seq/DAP-seq/CUT&Tag通常用于研究特定蛋白在基因组特定位置的结合情况，而ATAC-seq则关注染色质可及性。原理是，结合蛋白或染色质开放区域的DNA片段在测序时会比非结合片段的reads富集，形成“peak”。IGV工具概述 在掌握了基础知识后，让我们聚焦于如何使用IGV工具绘制这些图表。IGV是一款用户友好、...
[校内分散采购(用户自购)]DAP-seq测序采购结果公告 服务类项目采购公示表 采购计划单号:SQ22101792 公示项目名称 DAP-seq测序 用户单位名称 生命科学学院 联系人/电话 赵**/137***4791 采购计划预算 转/零A463水稻高产优质关键性状的分子机理 经费卡号 4600-E19203 项目需求 筛选互作片段 预算测算依据 ip和...
答案是:此图是测序reads的可视化,利用reads和参考基因组比对之后的结果,用来展示目标基因上的转录因子结合/组蛋白修饰/染色质开放性的。 " 鉴定转录因子在基因组上结合常用的技术手段是ChIP-seq/DAP-seq,检测组蛋白修饰的全基因组分布用ChIP-seq/CUT&Tag,而对染色质可及性的检测则用ATAC-seq。ChIP-seq/DAP-seq/...
答案是:此图是测序reads的可视化,利用reads和参考基因组比对之后的结果,用来展示目标基因上的转录因子结合/组蛋白修饰/染色质开放性的。 " 鉴定转录因子在基因组上结合常用的技术手段是ChIP-seq/DAP-seq,检测组蛋白修饰的全基因组分布用ChIP-seq/CUT&Tag,而对染色质可及性的检测则用ATAC-seq。ChIP-seq/DAP-seq...
答案是:此图是测序reads的可视化,利用reads和参考基因组比对之后的结果,用来展示目标基因上的转录因子结合/组蛋白修饰/染色质开放性的。 " 鉴定转录因子在基因组上结合常用的技术手段是ChIP-seq/DAP-seq,检测组蛋白修饰的全基因组分布用ChIP-seq/CUT&Tag,而对染色质可及性的检测则用ATAC-seq。ChIP-seq/DAP-seq...