1、starBase 一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。 网址:http://starbase./ 2、miRbase 众所周...
【期刊名称】中国医学装备 【年(卷),期】2018(015)010 【总页数】3 【关键词】[关键词] 微小核糖核酸;调控网络;Cytoscape 软件;基因本体 (GO)分析;KEGG 通路 *基金项目:北京市教育委员会科技发展计划(KM201710025010)“肿瘤力学 微环境关联 miRNA-mRNA 功能模块识别研究” 近年来,非编码核糖核酸 (ribonucleic ...
2.基于生物信息学构建骨肉瘤miRNA-mRNA的调控网络 [J], 袁长深;容伟明;卢智贤;段戡;郭锦荣;梅其杰 3.基于生物信息学方法构建类风湿性关节炎miRNA-mRNA调控网络 [J], 曹维维;袁成良 4.基于文献的冠心病血瘀证相关蛋白互作模块及miRNA-mRNA调控网络构建 [J], 谌子诺;王阶;陈恒文;刘咏梅;何浩强;陈光;杨光;周...
networkanalyst使用|预测TF-gene,TF-miRNA,disease-chemical等相互作用网络并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 5093 0 06:39 构建ceRNA网络方法。ceRNA图。生物信息 mRNA-lncRNA-miRNA图 生信分析666 1.9万 10 11:54 networkanalyst网站结合cytoscape软件构建gene-mirna-tf三联互作网络图 熬夜干科研 731 1 14:...
本期介绍的工具不仅是解决了以上问题,还能做出高大上的miRNA-mRNA网络图,是不是很心动呢? 1、starBase 一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构...
lncRNA—miRNA—mRNA的交互模式效应 解螺旋官方频道 3766 0 14:01 10.疾病-通路-靶点-成分-药物网络构建(Cytoscape) 药学生阿程 10.2万 127 08:20 如何使用Cytoscape做一个精美的ppi网络图(版本3.7.1) 黑眉锦蛇呀 1.6万 2 06:39 构建ceRNA网络方法。ceRNA图。生物信息 mRNA-lncRNA-miRNA图 生信...