CUT&Tag作为 2019年报道的蛋白和DNA互作的实验方法,发表过的研究已广泛应用多组学,其中最为普遍是“CUT&Tag+RNA-seq”组合。CUT&Tag和RNA-seq关联分析也比较套路,一般有以下几种。 1.CUT&Tag关联基因和RNA-seq的差异表达基因进行overlap。 ChIP-seq数据差异分析拿到关联基因的基因集,与RNA-seq数据的差异表达基因...
图3. CUT&Tag和RNA-seq分析发现KDM1A抑制可抑制DNA修复基因的表达 4. KDM1A抑制或敲除减少参与DNA修复的基因的表达由于GSCs具有较高的DNA修复能力,这是TMZ治疗耐药的主要因素,作者假设KDM1A抑制介导的TMZ敏感性可能与DNA修复基因的衰减有关。作者通过RNA-seq检测了使用载体、NCD38或TMZ单一疗法或两者联合处理的GSCs...
为了探究NR4A3介导的组蛋白乳酸化促进血管钙化的机制，研究人员通过对H3K18la进行CUT&Tag和RNA-seq分析，并联合血管平滑肌细胞钙化相关基因数据集，确定了3个调控NR4A3缺乏导致血管钙化的候选基因: Phospho1、Wnt7b和Wnt5a。H3K18la 的CUT&Tag数据分析表明：H3K18la与Phospho1启动子区结合，与基因表达密切相关。NR4A3...
其利用Western blotting、免疫荧光、RNA-seq、CUT&Tag、ChIP等实验技术探究在C2C12细胞中乳酸盐通过促进组蛋白H3K9乳酸化介导Neu2表达上调来促进肌肉发育的调控机制。
目标蛋白 CUT&Tag（如组蛋白修饰、转录因子、Pol II、CTCF）与R-loop CUT&Tag以及RNA-seq建库试剂联用，多组学数据联合分析，表观调控机制更清晰！若您对R-loop CUT&Tag感兴趣，欢迎垂询400-600-9335或联系您身边的诺唯赞人。Vazyme产品推荐 —点击表格查看产品详情—（转自：诺唯赞生物）
在研究中，CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合，分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平，尤其是启动子或增强子区域的靶基因，探究其对基因表达的调控作用。当目标蛋白为转录因子时，联合motif分析和共表达分析，研究可以进一步丰富转录因子-靶基因调控网络。同时，研究中会通过选择CUT&Tag和RNA-seq结果中的一些代表性位点...
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在研究中,CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合,分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平,尤其是启动子或增强子区域的靶基因,探究其对基因表达的调控作用。当目标蛋白为转录因子时,联合motif分析和共表达分析,研究可以进一步丰富转录因子-靶基因调控网络。同时,研究中会通过选择CUT&Tag和RNA-seq结果中的一些代表性位点,设计...
在研究中,CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合,分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平,尤其是启动子或增强子区域的靶基因,探究其对基因表达的调控作用。当目标蛋白为转录因子时,联合motif分析和共表达分析,研究可以进一步丰富转录因子-靶基因调控网络。同时,研究中会通过选择CUT&Tag和RNA-seq结果中的一些代表性位点,设计...
为进一步阐明ASH2L缺失导致CAKUT表型的分子机制,研究者通过RNA-seq和CUT&Tag数据的联合分析发现,UB特异性ASH2L敲除小鼠UB细胞中RET/GFRA1信号通路核心组分如Ret、Gfra1和Wnt11基因的表达显著减少,并且与ASH2L缺陷所导致的启动子区域H3K4me3修饰减少有关。 研究结果...