依托先进的Protein A/G-Tn5融合蛋白体系和高通量测序平台，我们为广大科研工作者提供CUT&Tag技术分析。一、文库构建和测序流程 从DNA样品到最终数据获得，样品检测、建库、测序每一个环节都可能会对数据质量和数量产生影响，而数据质量又会直接影响后续信息分析的结果。因此，获得高质量数据是保证生物信息分析正确、全面...
CUT&Tag技术 01 技术原理 02 送样要求 03 组蛋白修饰CUT&Tag实测结果展示 04 转录因子CUT&Tag实测结果展示 CUT&Tag案例解析 引言 蛋白质与DNA的相互作用是基因转录调控的关键环节,也是启动基因转录的重要前提。这种相互作用主要包括组蛋白、转录因子、DNA甲基化酶和染色质重塑复合物等。这些蛋白质与DNA的互作在细胞...
研究利用CUT&Tag技术分析了乳酸化修饰在PDAC中的基~因组分布及其对基~因表达的影响。通过CUT&Tag绘制了组蛋白乳酸化（H3K18la）在胰腺ai细胞基~因组中的结合图谱，研究发现H3K18la主要富集于肿liu相关基~因的启动子和增强子区域，结合RNA-seq数据表明，这些区域的乳酸化水平与糖酵解及肿liu相关基~因的高表达密切...
CUT&Tag目前的价格比较稳定,如果你有数据分析能力,即可自己购买试剂盒建库,再交由测序公司进行扩增测序,自己再对原始数据进行分析,将会剩下一大笔费用。 CUT-Tag下机数据处理 1.下机数据 CUT-Tag本质上是对转录因子所下拉得DNA序列进行二代测序,因此下机数据和转录组的所类似为fsatq序列。 下机数据 2.质量控制 ...
接下来我将介绍cut&tag数据上游分析流程 首先拿到公司测序得到的fastq文件(Raw Data),上传到服务器的特定文件夹中,例如/home/zyn/cut&tag/fastq 质控 cd/home/zyn/#注意mkdir -p ./cut&tag/fastq报错,是因为&符号在Linux shell中有特殊意义,它用于将一个命令放入后台执行。mkdir./cut-tag/fastq# ---># QC...
CUT&Tag本身是一种高通量测序技术,zui终所获取的实验结果也是测序文库。CUT&Tag的文库与ChIP-Seq类似,都是200-1000bp左右的文库。测序所得的数据可以用常规的分析软件进行分析,无需特殊的分析软件。一般的实验流程为:细胞与磁珠结合—一抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片段化—DNA提取—PCR构建文库—文库纯化—质检...
在研究中，CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合，分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平，尤其是启动子或增强子区域的靶基因，探究其对基因表达的调控作用。当目标蛋白为转录因子时，联合motif分析和共表达分析，研究可以进一步丰富转录因子-靶基因调控网络。同时，研究中会通过选择CUT&Tag和RNA-seq结果中的一些代表性位点...
附图1:小鼠细胞系混合物的 scCUT&Tag结果 1、小鼠大脑中几种组蛋白修饰的单细胞图谱及评估 对所有细胞的合并数据集的伪bulk分析显示了不同组蛋白修饰技术的特异性。特别是H3K4me3主要存在于转录起始位点的侧翼区域，H3K27ac同时占据这些区域和邻近的基因间区域（很可能是增强子），H3K36me3分布在整个基因体中。而...
第五讲——ATAC-seq和CUT&Tag原理与分析, 视频播放量 3696、弹幕量 3、点赞数 34、投硬币枚数 25、收藏人数 176、转发人数 34, 视频作者 菲沙基因, 作者简介 以生物信息学助推生命科学的研究,以基因组医学促进人类健康的发展;,相关视频:第三讲——ATAC-Seq原理与分析,