CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基因组上的结合或分布位点。相比于传统的ChIP-seq技术,CUT&Tag反应在细胞内进行,创新性地使用了ProteinA/G-Tn5融合蛋白来结合目的蛋白上的抗体,并特异性切割目的蛋白结合的DNA,最终通过结合NGS实...
CUT&Tag文库定量 总结 参考文献 背景介绍 近年来,ATAC-seq和CUT&Tag已然成为研究染色质结构的热门技术手段。 ATAC-seq(Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high throughoutsequencing)利用Tn5酶的转座特性,帮助我们了解开放染色质,转录因子印记和核小体的定位。 而同样使用Tn5转座酶的CUT&Tag技术则是利用靶...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基因组上的结合或分布位点。相比于传统的ChIP-seq技术,CUT&Tag反应在细胞内进行,创新性地使用了ProteinA/G-Tn5融合蛋白来结合目的蛋白上的抗体,并特异性切割目的蛋白结合的DNA,最终通过结合NGS实...
http://www.vazyme.com/product/279.htmlCUT&Tag技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法,通过将Protein G或Protein A与经过工程学改造的超高活性Tn5转座酶融合,形成兼具双重活性的新型融合酶(Hyperactive pG-Tn5/pA-Tn5 Transposase),在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附
CUT&Tag文库质检 在CUT&Tag实验步骤中,没有细胞裂解步骤来分离细胞核。 完整的细胞首先与磁性ConcanavalinA珠结合,再将一抗与DNA上的组蛋白标记或转录因子目标结合,然后结合二抗以增加信号,并用连有adapter的pA-Tn5来靶向二抗使其切割该位置的DNA。 与ATAC-Seq不同的是,CUT&Tag文库不会有那么多的小片段,因为pA-...
经项目负责人申请,按照《四川大学落实赋予科研管理更大自主权的补充规定》(川大校〔2020〕1号)的相关规定,现对以下项目进行公示: 一、项目信息 项目名称:cut-tag文库9条lane单上机测序服务 ...
ATAC-seq和CUT&Tag文库通常来源于完整细胞核或细胞,转座体穿过细胞膜进入染色质内部进行转座反应,同时将测序接头序列与片段化的DNA相连接。这种可及性受到多种因素影响,如细胞类型、数量、活性、结团状态及Tn5与DNA的比例,从而导致文库片段存在较大差异。研究者经常询问:“我的文库是否正常,是否可以...
从以上研究案例可知,CUT&Tag技术可以识别全基因组中目标蛋白占据的位置的序列信息,这种目标蛋白包含各类组蛋白和转录因子,同时还可以研究染色质本身的特殊结构(G4)。所要求的条件需要有相对应的抗体。CUT&Tag文库质检要求 CUT&Tag文库的特征与常见的转录组或基因组文库不同,它通常与所研究的蛋白有关,文库峰图...
cuttag蛋白互作 CUT&Tag技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法。 该技术使用磁珠吸附活细胞,利用digitonin增加细胞膜通透性。靶蛋白特异性抗体(一抗)进入细胞与靶蛋白结合,二抗孵育放大信号,pA/G-Tn5融合蛋白与一抗和二抗结合,把转座体间接的固定在靶蛋白上。Mg2+激活Tn5酶,切割靶标区域。由于Tn5连有测序接头,在...
cut tag原理 你可以把细胞想象成一个超级繁忙的小工厂,里面各种各样的分子就像工人一样忙忙碌碌地干着活儿呢。这cut tag呀,就像是这个小工厂里一种特别的管理方式。 在细胞这个小世界里呢,蛋白质就像是非常重要的员工,它们有着各种各样的功能。而DNA就像是工厂的蓝图,指挥着蛋白质该怎么工作。有时候呢,我们...