CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基因组上的结合或分布位点。相比于传统的ChIP-seq技术,CUT&Tag反应在细胞内进行,创新性地使用了ProteinA/G-Tn5融合蛋白来结合目的蛋白上的抗体,并特异性切割目的蛋白结合的DNA,最终通过结合NGS实...
探索CUT&Tag技术的过程是精确而系统的,从样本制备到文库构建,每一步都需严格把控。选择新鲜的样本、适当的抗体、优化磁珠处理、精确控制酶切条件,这些关键步骤共同确保了CUT&Tag的高效富集和准确分析。 爱基百客拥有10年表观遗传学研究服务的经验,表观组学和单细胞测序平台技术已十分完善。我们提供从大规模(Bulk级别...
接下来小远给大家介绍一篇文献,便于大家对CUT&Tag技术有一个详细和深入的了解。 2020年,浙江大学关雪莹团队在Plant Methods发表了题为“Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag”的研究论文,基于动物细胞中CUT&Tag的文库构建方法,作者开发了一套在植物中构建CUT&Tag文库的方法,...
http://www.vazyme.com/product/279.htmlCUT&Tag技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法,通过将Protein G或Protein A与经过工程学改造的超高活性Tn5转座酶融合,形成兼具双重活性的新型融合酶(Hyperactive pG-Tn5/pA-Tn5 Transposase),在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附
CUT&Tag技术流程 一、技术优势 与传统的ChIP-seq技术相比，CUT&Tag在多个维度上表现优异：1.背景噪声更低：无需化学交联，减少非特异性结合。2.分辨率更高：可清晰定位到转录因子和组蛋白修饰的结合区域。3.加速实验周期：整合片段化与文库构建流程，大幅缩短实验周期 二、送样建议 我们的CUT&Tag分析通过高效的转座...
2020年,浙江大学关雪莹团队在Plant Methods发表了题为“Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag”的研究论文,基于动物细胞中CUT&Tag的文库构建方法,作者开发了一套在植物中构建CUT&Tag文库的方法,并比较了棉花叶片CUT&Tag与ChIP-seq的文库构建效率。与ChIP-seq相比,CUT&Tag处理...
CUT&Tag简介 CUT&Tag是一种利用高活性Tn5转座酶锚定技术进行高效、高分辨率DNA测序文库构建的方法，适用...
CUT&Tag插入片段长度的离散程度能直接反映出文库制备的效果。通过插入片段两端的Reads在参考基因组上的比对起止点之间的距离计算插入片段长度。从下图可以看出,两个技术性重复的插入片段均呈周期性分布,结果与Agilent 2100质检结果相似,同时两个技术重复之间也保持较高的一致性。
与ChIP-seq相比，CUT&Tag具有显著优势，如：信噪比高，可重复性好，实验周期短（1天实现从细胞到文库构建），细胞投入量低等，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。图1 CUT&Tag实验流程图(Kaya-Okur et al., 2019)。二、CUT&Tag质控1.CUT&Tag文库质控 CUT&Tag文库的质控是CUT&Tag...
CUT&Tag技术的核心是使用Protein A/G-Tn5转座体复合物(pA/G-Tn5),在抗体引导下,pA/G-Tn5直接结合目的蛋白并切割目的蛋白附近的DNA序列,切割后的DNA片段直接用于建库测序。 二、操作流程 1.细胞收集:收集适量的细胞,通常为10^5-10^7个细胞。 2.抗体孵育:将细胞与特异性抗体在冰上孵育一段时间,使抗体与目的...