CUT&Tag文库定量 总结 参考文献 背景介绍 近年来,ATAC-seq和CUT&Tag已然成为研究染色质结构的热门技术手段。 ATAC-seq(Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high throughoutsequencing)利用Tn5酶的转座特性,帮助我们了解开放染色质,转录因子印记和核小体的定位。 而同样使用Tn5转座酶的CUT&Tag技术则是利用靶...
ATAC-seq和CUT&Tag文库通常来源于完整细胞核或细胞,转座体穿过细胞膜进入染色质内部进行转座反应,同时将测序接头序列与片段化的DNA相连接。这种可及性受到多种因素影响,如细胞类型、数量、活性、结团状态及Tn5与DNA的比例,从而导致文库片段存在较大差异。研究者经常询问:“我的文库是否正常,是否可以继...
与其他测序文库相比,ATAC-Seq和CUT&Tag 文库的质量评判更加具有不确定性,因为不同的样品类型或不同的预处理之间可能有相当大的差异。 ATAC-seq和CUT&Tag的文库通常从完整的细胞核或完整的细胞中制备,转座体通过核膜或细胞膜进入到染色质内部进行转座反应,并将测序接头序列与片段化的DNA相连接。 这种可及性会受到细...
与其他测序文库相比,ATAC-Seq和CUT&Tag 文库的质量评判更加具有不确定性,因为不同的样品类型或不同的预处理之间可能有相当大的差异。 ATAC-seq和CUT&Tag的文库通常从完整的细胞核或完整的细胞中制备,转座体通过核膜或细胞膜进入到染色质内部进行转座反应,并将测序接头序列与片段化的DNA相连接。 这种可及性会受到细...