通过对这篇文章的部分解读可知：1）CUT&Tag不仅可以用于研究组蛋白和转录因子这种蛋白，也可以用于研究核酸序列，前提是有合适的抗体；2）CUT&Tag技术与ChIP-seq相比具有多方面的优势。当然，我们此次解读的这篇文章研究内容非常丰富，信息量大，篇幅所限，不做一一介绍，感兴趣的可以查看原文。上海欧易生物完成了多例...
CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作新兴的实验方法,该方法是通过蛋白特异性抗体引导Protein A-Tn5酶在目标蛋白结合的DNA位置进行切割,并且在序列两端加上测序接头,经过PCR扩增后形成可用于高通量测序的文库,随后对文库进行测序分析从而解析与目标蛋白结合的DNA片段。 CUT&Tag技术原理 02 实验流程 CUT&Tag实验流程较为简便,首先...
一、CUT&Tag技术介绍 CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是替换传统ChIP-seq技术来研究与目标蛋白质互作DNA的新技术。与ChIP-seq相同的是都需要利用抗体识别并结合目标蛋白，不同点在于CUT&Tag技术是利用Tn5转座酶与Protein A/G的融合蛋白，通过二抗把Tn5酶复合体引导至目标染色质区域，Tn5转座酶在...
CUT&Tag和ChIP 技术的实验原理类似,均利用抗体与目标蛋白特异性结合来富集与之相互作用的DNA片段。CUT&Tag技术的核心是将Tn5转座酶进行改造,融合proteinA/G(形成pA/G-Tn5融合蛋白),其优点是特异性强,灵敏度高,背景噪音较低,重复性好,并且对样本要求量少。现在,CUT&Tag已成为组蛋白翻译后修饰(PTM)和从包括单细...
【注】A：在CUT&Tag实验开始前，我们需要确定实验方案。随着CUT&Tag技术的发展,科学家们发现有些目标蛋白质在研究时，轻微甲醛交联效果更好。之后，更多的研究表明，使用CUT&Tag技术研究不同蛋白时，所需的实验条件也不一样。做组蛋白修饰、强结合的转录因子(如CTCF、RNA polll等)无需甲醛交联。而一些弱结合的...
单细胞技术爆火的现在,scCUT&Tag技术中,各种动物、细胞以及植物的文章见刊,并且CUT&Tag技术还衍生出了多靶标CUT&Tag,实现一个细胞,多个靶标的研究。
一、CUT&Tag技术发展历程 ChIP-Seq (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing) 因能真实、完整地反映靶蛋白与DNA序列的结合情况,因而成为一直以来研究DNA-蛋白相互作用的经典方法。但ChIP-Seq继承了ChIP的难点与局限性:需要大量细胞投入(10...
CUT&Tag技术的应用 自从2019年CUT&Tag技术出现，迄今为止已经有多篇论文应用该技术进行组蛋白、转录因子功能研究。例如在拟南芥雄配子发育过程中，H3K27甲基化状态的改变可以影响雄配子体中两个细胞系的命运。H3K27me3通常在含有沉默基因的染色质区域富集。研究人员通过CUT&Tag技术发现拟南芥雄配子中的营养细胞有6950个...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是替换传统ChIP-seq技术来研究与目标蛋白质互作DNA的新技术。与ChIP-seq相同的是都需要利用抗体识别并结合目标蛋白,不同点在于CUT&Tag技术是利用Tn5转座酶与Protein A/G的融合蛋白,通过二抗把Tn5酶复合体引导至目标染色质区域,Tn5转座酶在剪切DNA的同时,在插入位点连...