在CUT&RUN中,抗体靶向目标蛋白从而结合在完整细胞中的染色质上,然后微球菌核酸酶 (MNase) 在目标蛋白结合位点特异性地剪切DNA,所释放的DNA片段被纯化、测序并定位到参考基因组序列上,就可推断出蛋白在DNA上的结合位点。ChIP需要将蛋白与DNA交联,这一步可能导致假阳性,而CUT&RUN不需要交联反应。 作为研究染色质相关...
纽科生物CUT&RUN测序在线分析云平台是由上海纽科生物科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2023SR1076794,属于分类,想要查询更多关于纽科生物CUT&RUN测序在线分析云平台著作的著作权信息就到天眼查官网!
将修复纯化的CUT&RUN DNA连接到测序adapter上,并进行PCR扩增以生成测序文库。PCR扩增使用了针对CUT&RUN低产量和小片段规格的优化参数,条形码引物用于实现多路测序。EpiCypher的Library Prep Kit经过专门优化,可以进一步简化您的工作流程。 在测序之前,确认CUT&RUN成功的最佳方法是对纯化文库进行片段大小分布的分析。使用毛细...
以CST 备受欢迎的CUT&RUN试剂盒#86652为例:首先将细胞固定在伴刀豆球蛋白A磁珠上,然后用洋地黄皂苷通透细胞膜,加入一抗和pAG-MNase(Protein A-Protein G-微球菌核酸酶),一抗募集pAG-MNase到靶蛋白上,0度条件下添加Ca2+激活pAG-MNase,并切割靶蛋白两侧的DNA,使其从基因组中释放出来,扩散到上清中。上清中的DNA...
图1.CUT&RUN实验流程图 (Skene et al., 2018)。 2019年,Steven Henikoff团队使用pA-Tn5替代pA-MNase,推出了CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术,其原理与CUT&RUN类似,首先通过刀豆蛋白A包被的磁珠(ConA beads)吸...
核酸酶靶向切割和释放 (CUT&RUN),与染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测一样, 是一项用于在细胞天然染色质环境下检测蛋白-DNA 相互作用的强大通用技术。该技术自2020年问世以来,以所需细胞量少、背景低、易操作等多种优势,被广大科研工作者所青睐,也收到了来自终端用...
我们知道,CUT&Tag和CUT&RUN技术都是Steven Henikoff开发的,2017年先发表了CUT&RUN,使用pA-MNase切割目标蛋白结合的DNA,得到的DNA需要进行末端修复加A加接头的过程。2019年发表的CUT&Tag中使用pA-Tn5转座子,切割后得到的DNA就已经添加了测序接头,大幅简化了操作步骤,因此更受到大家青睐。
图1.CUT&RUN实验流程图 (Skene et al., 2018)。 2019年,Steven Henikoff团队使用pA-Tn5替代pA-MNase,推出了CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术,其原理与CUT&RUN类似,首先通过刀豆蛋白A包被的磁珠(ConA beads)吸附细胞(与细胞膜上的糖蛋白结合),通过洋地黄皂苷在细胞膜上“打孔”,在抗体引导...
CUT&RUN的主要步骤是首先将细胞通透化,随后加入目的蛋白抗体特异性的结合在目的蛋白处,并招募和protein A/G偶联的微球菌核酸酶(pA/G-MNase),最后加入Ca²⁺激活MNase活性,切割目标区域的DNA并回收,用于qPCR检测或NGS建库测序。 CUT&RUN实验流程: 1. 收获细胞并和beads结合:...
CUTANATM CUT&RUN AND LIBRARY PREP KITS EpiCypher的CUTANA™ CUT&RUN AND LIBRARY PREP KITS为用户提供了染色质定位实验的细胞-测序解决方案,该试剂盒包含了从细胞到测序流程中所有必要的对照以及验证试剂,充分确保实验能够获得高质量数据。 √ CUT&RUN首推产品! √ 功能全面,新人必备!√ 兼容性强:新鲜、冷冻...