测序手段:CUT&Tag、ChIP-seq、RNA-seq 研究亮点:该研究通过CUT&Tag及ChIP-seq揭示了组蛋白磷酸化修饰快速响应饥饿刺激的胰高血糖素-PKA信号通路,联合RNA-seq发现可进一步促进肝脏糖异生基因转录的工作机制,丰富了对机体在染色质层面如何响应激素变化,调控代谢稳态的生物学认识。 文献五 H3S57ph在DNA损伤修复中的关...
CUT&Tag(Cleavage Under Targetsand Tagmentation),即靶向剪切及转座酶技术,是⼀种利用酶锚定技术进行高效、高分辨率的DNA测序文库构建方法,也是替换传统的ChIP-Seq用以研究蛋白质-基因组互作关系研究的新方法,属于新⼀代超微量ChIP-Seq技术。可用于检测组蛋白、RNApolymeraseII和转录因⼦等具有DNA结合功能的蛋白种...
CUT&Tag是针对ChIP-Seq的局限性而创建的研究基因组中组蛋白修饰以及染色质结合蛋白和DNA相互作用的高效新技术。尽管与ChIP-Seq原理相似,CUT&Tag可以在新鲜细胞原生的状态下,利用Tn5转座酶复合体转座的特性在获取片段化DNA的同时完成了末端添加建库测序所需的扩增引物及条形码序列。它具备了操作简单快速(1-2天可完成建...
CUT&Tag测序 「CUT&Tag测序」 CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),即靶向剪切及转座酶技术,是一种利用酶锚定技术进行高效、高分辨率的DNA测序文库构建方法,同时是一种新的DNA-蛋白质互作研究方法,可用于检测组蛋白、RNApolymeraseII和转录因子等具有DNA结合功能的蛋白种类,揭示更多染色质在调控基因表达...
2019年,Henikoff实验室发明了CUT&Tag,使用ProteinA/G-Tn5从而简化了二代测序的步骤,并且极大降低了细胞的起始数量。 2.CUT&Tag 1)实验原理 CUT&Tag是蛋白质与DNA互作的革新技术,无需通过甲醛交联以及免疫共沉淀,其核心技术为pA/G-Tn5 Transposase,将Protein A/G与Tn5转座酶进行融合,使得与抗体结合的同时,Tn5...
在CUT&Tag中,染色质蛋白被特异性抗体原位结合,然后将蛋白-Tn5转座酶融合蛋白结合在一起。转座酶的激活导致染色质在接近蛋白质结合位点处被切割,同时添加了NGS衔接子DNA序列,并有效地产生了具有高分辨率和极低背景的片段文库。从活细胞到可测序的文库的所有步骤均可在台式单管或高通量管线中的微孔中进行,整个过程可在...
图4.CUT&Tag在单细胞上的应用 (上图(Wu et al., 2021);下图(Bartosovic et al., 2021))。 五、Vazyme重磅推出新品TD903 2019年,南京诺唯赞生物科技股份有限公司(Vazyme Biotech)首次推出CUT&Tag试剂盒(TD901、TD902),使用...
4.CUT&Tag 是超快的蛋白质-DNA相互作用研究方法,细胞到DNA文库仅需1-2天。 5.适合单细胞染色质分析。 6.低背景,仅需约 2 M高质量读长,节省测序成本。 基因有限公司作为CST授权经销商,为您的实验提供优质的支持和帮助! 如果您对这款产品感兴趣,
客户寄语：CUT&Tag是研究蛋白质与DNA互作的新方法。与传统ChIP-Seq相比，该技术操作简单，信噪比高。我们也是第一次尝试用CUT&Tag来做H3K9me3修饰的ChIP，效果还蛮好的，对文章的提升帮助很大。公司的技术人员也积极向我们解释这个新技术的原理以及数据的处理的细节，合作比较愉快。性染色体的起源需要在原性染色体之间...
建库步骤简单成本降低背景低因此可以降低测序深度没有甲醛交联造成的假阳性结果 CUT&Tag技术介绍 CUT&Tag是一种新的实验方法,用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位,从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。 MNase-Seq和ATAC-Seq是把开放染色质作为研究对象,因此相当依赖于染色质的开放...