CTCF是控制染色质高级结构和表观遗传的关键蛋白,具有组织染色质高级结构、调控基因转录、作为绝缘子蛋白、参与遗传印记和参与选择性剪接等多种功能。CTCF突变会引起人类小头畸形症和智力低下;条件敲除CTCF,能够引发小鼠神经元缺失并阻断淋巴细胞的增殖和分化,增加肿瘤发生的机会;CTCF还可以帮助细胞抵抗凋亡和UV带来的伤害。
在3D水平上,CTCF和先锋转录因子形成调控中心来控制细胞身份基因的表达。上述机制已使用MyoD缺失小鼠、CTCF敲除小鼠和生肌分化过程中的CRISPR编辑进行了验证。文中ATAC-seq实验由上海嘉因生物协助完成。END 上海嘉因生物 2014年伊始 专注表观遗传10年 更专业 更放心1嘉因生物-ATAC-seq介绍ATAC-seq(Assay for Transposase...
与ATAC-seq和CTCF Cut&Run的分析结果不同,DARs周围的DNA甲基化水平在对照组和CTCF耗竭组之间没有发现有差异性(图S9A)。接下来分析差异甲基化区域(DMRs),发现只有49个显著差异区域(图S9B)。进一步检查这些增强的DMRs富集的motif,并没有发现CTCF或黏连蛋白(图S9C),表明这些DMRs与CTCF占用没有直接关联。总之,研究...
Eg:EKLF打掉红细胞就不能运输氧气。 CTCF组织染色体结构的作用,可以使得性染色体失活,作为检测疾病的指标。在转录过程中的情况: 调控基因印记,父源gene甲基化不能表达,母源gene有CTCF(impromoter)没甲基化能表达: A-USF在胚胎发育中的作用结果: 机制是 HATs组蛋白乙酰化阻断酶或者它组成复合物,改变下游gene开放程度...
刷刷题APP(shuashuati.com)是专业的大学生刷题搜题拍题答疑工具,刷刷题提供ChIP-seq数据分析会有不同类型的峰,CTCF结合位点的峰是窄峰,RNA Pol II结合位点的峰是宽峰。()A.正确B.错误的答案解析,刷刷题为用户提供专业的考试题库练习。一分钟将考试题Word文档/Excel文
作者假设,Matr3的缺失通过减少黏着蛋白负载来破坏黏着蛋白-CTCF复合物结合的稳定性,从而改变了染色质结构环并影响远距离相互作用。作为一种黏着蛋白损失的部分补偿机制,YY1被招募到染色质位点,从而破坏E-P环。总而言之,在肌肉发生过程中,YY1介导的E-P环的获得可能有助于MyoD的招募,导致骨骼肌发育过程中基因表达的...
Recovery of known enhancers and CTCF footprinting by ATAC-seq.doi:10.1371/journal.pgen.1004994.g003Davie KristoferJacobs JelleAtkins MardelleP. DelphineChristiaens ValerieHalder GeorgA. SteinPLOS Genetics
吴刚, 担任深圳市鹏翔国际旅行社有限公司、深圳市公共汽车有限公司等高管。 任职全景图 投资、任职的关联公司 商业关系图 一图看清商业版图 合作伙伴 了解老板关系,合作伙伴 关联企业2 担任法定代表人0 担任股东0 担任高管2 所有任职企业2 作为最终受益人0 所属集团0 历史信息 曾担任法定代表人 曾担任股东 曾担...
ChIP-seq provides a wealth of information on the approximate location of DNA-binding proteins genome-wide. It is known that the targeted motifs in most cases can be found at the peak centers. A high resolution mapping of ChIP-seq peaks could in principle
CTCF是控制染色质高级结构和表观遗传的关键蛋白,具有组织染色质高级结构、调控基因转录、作为绝缘子蛋白、参与遗传印记和参与选择性剪接等多种功能。CTCF突变会引起人类小头畸形症和智力低下;条件敲除CTCF,能够引发小鼠神经元缺失并阻断淋巴细胞的增殖和分化,增加肿瘤发生的机会;CTCF还可以帮助细胞抵抗凋亡和UV带来的伤害。