近日，奥地利维也纳生物中心Jan-Michael Peters研究组在Nature 发表了文章CTCF is a DNA-tension-dependent barrier to cohesin-mediated loop extrusion，通过将单个CTCF与DNA上粘连蛋白相互作用可视化，发现CTCF可以阻断Cohesin的传播从而的阻断DNA环挤出过程，且该过程依赖于DNA张力。 CTCF位于TAD的边界，是TAD形成的...
本发明公开了一种多功能转录调控因子CTCF的DNA结合位点CTCF_94的新用途,即其在制备用于结直肠肿瘤早期诊断试剂盒中的应用,该结合位点核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;本发明提供的CTCF结合位点无论是检测结直肠腺瘤还是结直肠癌的准确性都要显著高于已报道的DNA甲基化分子标记;而且CTCF的DNA结合位点还有可能成为肿瘤治疗...
进一步的核磁主链动力学、残余偶极耦合和小角X射线散射实验证实了在未结合核酸状态下,CTCF ZFs 1-11具有相当的柔性。来自于原钙粘蛋白基因簇的两段不同DNA片段和CTCF ZFs 1-11的核磁结合实验表明CTCF采用不同区段锌指、以不同的结合强度进行应答;结合CTCF ZFs 1-11的化学位移指认,从而可系统性地研究染色质上的...
CTCF具有方向性,并确定DNA环开始和结束的位置 DNA结合蛋白CTCF被发现在基因组的DNA环定位中起着关键作用。Dekker指出,“如果你把DNA想象成一条绳子,CTCF好比旗帜一样被固定在两个位点上,黏连蛋白从一个旗帜到另一个旗帜制造DNA环,但前提是CTCF的定位正确。只有CTCF蛋白的一侧能够与黏连蛋白相互作用。然后,它并不总...
4. DNA甲基化在体内调节APA HEATR2和NFYA基因的实验数据展示了一种DNA甲基化调控APA的模型,在这个模型中,CTCF结合到两个动态poly(A)间的非甲基化APA调控区,进一步通过建立黏连蛋白介导的染色质环以此阻碍转录延伸,促使近端poly(A)位点的使用。相反,APA调控区域DNA的甲基化阻碍CTCF结合,因此妨碍染色质环的形成,促使...
1.通过HILO显微镜观察图像检验体外模型是否work:要做的事情简单说起来有两件,第一检验CTCF蛋白是否能够与CTCF-bingding region结合,其二要检验Cohesin介导的loop是否可以在此模型中被CTCF所Block;下图中可以看见游离的CTCF在结合到DNA上的位点前是呈无规律运动的,当约6min后其位置稳定下来,说明其已经能够介导的DNA的位...
In eukaryotes, genomic DNA is extruded into loops by cohesin1. By restraining this process, the DNA-binding protein CCCTC-binding factor (CTCF) generates topologically associating domains (TADs)2,3 that have important roles in gene regulation and recombi
一种CTCF蛋白可结合DNA片段及在CTCF活性检测中的应用专利信息由爱企查专利频道提供,一种CTCF蛋白可结合DNA片段及在CTCF活性检测中的应用说明:本发明涉及一种CTCF蛋白可结合的DNA片段,其包含一个或多个CTCF蛋白结合框,每个CTCF...专利查询请上爱企查
基因组DNA(gDNA) 描述 CTCF ——(c.781+2T>C) 核苷酸变异 c.781+2T>C 氨基酸变异 —— 等位基因频率 16% 缓冲液 Tris-EDTA(10 mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0 浓度 50 ng/uL 总量 1 ug 运输条件 常温运输 储存 -20 ℃保存36个月
真核生物基因组在增强子,启动子和绝缘子等DNA元件的组织下,形成高度有序的结构,辅助基因组实现复杂而精细的转录调控.绝缘子结合蛋白CTCF(CCCTC-binding factor)在cohesin的辅助下特异性地介导基因组范围内的DNA相互作用.但是CTCF介导特异性相互作用的原因还不清楚.人或小鼠Pcdh基因簇包括超过50个基因,每个基因具有一个独...