在真核生物中，粘连蛋白Cohesin将基因组DNA挤压成环，CTCF则通过限制这一过程形成DNA拓扑关联结构域（Topologically associating domains，TADs），在发育和疾病发生过程中对基因调控有重要作用【1-2】。但是CTCF是如何确定拓扑关联结构域边界以及Cohesin是如何参与其中的还不得而知。近日，奥地利维也纳生物中心Jan-Michael P...
CTCF是一种染色质结构修饰因子,能够结合DNA并影响染色质的构象。它通过与特定序列的DNA结合,调节基因的表达和染色质的组织结构。研究表明,CTCF的结合能够影响组蛋白的修饰状态。 首先,CTCF能够与组蛋白H3和H4的特定位点相互作用,通过改变这些位点的乙酰化、甲基化等修饰状态,进而影响基因的表达。其次,CTCF的结合还能促进...
CTCF具有方向性,并确定DNA环开始和结束的位置 DNA结合蛋白CTCF被发现在基因组的DNA环定位中起着关键作用。Dekker指出,“如果你把DNA想象成一条绳子,CTCF好比旗帜一样被固定在两个位点上,黏连蛋白从一个旗帜到另一个旗帜制造DNA环,但前提是CTCF的定位正确。只有CTCF蛋白的一侧能够与黏连蛋白相互作用。然后,它并不总...
进一步的核磁主链动力学、残余偶极耦合和小角X射线散射实验证实了在未结合核酸状态下,CTCF ZFs 1-11具有相当的柔性。来自于原钙粘蛋白基因簇的两段不同DNA片段和CTCF ZFs 1-11的核磁结合实验表明CTCF采用不同区段锌指、以不同的结合强度进行应答;结合CTCF ZFs 1-11的化学位移指认,从而可系统性地研究染色质上的...
本发明公开了一种多功能转录调控因子CTCF的DNA结合位点CTCF_55的新用途,即其在制备用于结直肠肿瘤早期诊断试剂盒中的应用,该结合位点核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;本发明提供的CTCF结合位点无论是检测结直肠腺瘤还是结直肠癌的准确性都要显著高于已报道的DNA甲基化分子标记;而且CTCF的DNA结合位点还有可能成为肿瘤治疗...
1.通过HILO显微镜观察图像检验体外模型是否work:要做的事情简单说起来有两件,第一检验CTCF蛋白是否能够与CTCF-bingding region结合,其二要检验Cohesin介导的loop是否可以在此模型中被CTCF所Block;下图中可以看见游离的CTCF在结合到DNA上的位点前是呈无规律运动的,当约6min后其位置稳定下来,说明其已经能够介导的DNA的位...
真核生物基因组在增强子,启动子和绝缘子等DNA元件的组织下,形成高度有序的结构,辅助基因组实现复杂而精细的转录调控.绝缘子结合蛋白CTCF(CCCTC-binding factor)在cohesin的辅助下特异性地介导基因组范围内的DNA相互作用.但是CTCF介导特异性相互作用的原因还不清楚.人或小鼠Pcdh基因簇包括超过50个基因,每个基因具有一个独...
【Nature | Cohesin-CTCF锚定DNA环的结构基础】黏连蛋白(Cohesin)催化基因组折叠形成DNA环,而这些环被CTCF所锚定。细胞间期的基因组会通过黏连蛋白以及CTCF的作用折叠成3D结构,这些结构因子与其他的调控因子相互作用从而调控基因的表达。但是一直以来黏连蛋白以及CTCF是如何将基因组折叠形成3D基因组结构其中的分子机制...
法国欧洲分子生物实验室Daniel Panne、Kyle W. Muir与荷兰癌症研究所Benjamin D. Rowland、Elzo de Wit等研究人员合作,解析了黏连蛋白(cohesin)与CTCF锚定DNA环的结构基础。 2020年1月6日,国际知名学术期刊《自然》在线发表了这一成果。 研究人员发现,CTCF N末端的一段与cohesin的SA2-SCC1亚基相互作用。
货号:HXSRM1287形式:基因组DNA(gDNA) 描述:CTCF ——(c.781+2T>C)核苷酸变异:c.781+2T>C 氨基酸变异:——等位基因频率:16% 缓冲液:Tris-EDTA(10 mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0浓度:50 ng/uL 总量:1 ug运输条件:常温运输 储存:-20 ℃保存36个月 ...