在真核生物中，粘连蛋白Cohesin将基因组DNA挤压成环，CTCF则通过限制这一过程形成DNA拓扑关联结构域（Topologically associating domains，TADs），在发育和疾病发生过程中对基因调控有重要作用【1-2】。但是CTCF是如何确定拓扑关联结构域边界以及Cohesin是如何参与其中的还不得而知。近日，奥地利维也纳生物中心Jan-Michael P...
进一步的核磁主链动力学、残余偶极耦合和小角X射线散射实验证实了在未结合核酸状态下,CTCF ZFs 1-11具有相当的柔性。来自于原钙粘蛋白基因簇的两段不同DNA片段和CTCF ZFs 1-11的核磁结合实验表明CTCF采用不同区段锌指、以不同的结合强度进行应答;结合CTCF ZFs 1-11的化学位移指认,从而可系统性地研究染色质上的...
CTCF具有方向性,并确定DNA环开始和结束的位置 DNA结合蛋白CTCF被发现在基因组的DNA环定位中起着关键作用。Dekker指出,“如果你把DNA想象成一条绳子,CTCF好比旗帜一样被固定在两个位点上,黏连蛋白从一个旗帜到另一个旗帜制造DNA环,但前提是CTCF的定位正确。只有CTCF蛋白的一侧能够与黏连蛋白相互作用。然后,它并不总...
【Nature | Cohesin-CTCF锚定DNA环的结构基础】黏连蛋白(Cohesin)催化基因组折叠形成DNA环,而这些环被CTCF所锚定。细胞间期的基因组会通过黏连蛋白以及CTCF的作用折叠成3D结构,这些结构因子与其他的调控因子相互作用从而调控基因的表达。但是一直以来黏连蛋白以及CTCF是如何将基因组折叠形成3D基因组结构其中的分子机制...
本研究作者通过比较DNA甲基化转移酶正常细胞(HCT116)和双缺陷型细胞(DKO)全基因组甲基化和聚腺苷化位点使用情况,发现了DNA甲基化调控APA的机制。结果表明,去除DNA甲基化可以使CTCF(CCCTC-binding factor)与之结合同时招募黏连蛋白复合体,进而形成染色质环,促使近端聚腺苷化位点的使用。在DNA去甲基化的情况下,CTCF...
and Yu, X. (2017). CTCF participates in DNA damage response via poly(ADP-ribosyl)ation. Sci. Rep. 7, 43530.Han D, Chen Q, Shi J, Zhang F, Yu X. CTCF participates in DNA damage response via poly(ADP-ribosyl)ation. Scientiic Reports. 2017;7:43530...
1.通过HILO显微镜观察图像检验体外模型是否work:要做的事情简单说起来有两件,第一检验CTCF蛋白是否能够与CTCF-bingding region结合,其二要检验Cohesin介导的loop是否可以在此模型中被CTCF所Block;下图中可以看见游离的CTCF在结合到DNA上的位点前是呈无规律运动的,当约6min后其位置稳定下来,说明其已经能够介导的DNA的位...
CTCF c.781+2T>C基因组DNA标准品价格: ￥900.00 货号: HXSRM1287 总量: 1 ug 浓度: 50 ng/uL 购买数量: 库存量:50 加入购物车 购买 产品保证 品质保证 干冰运输另加200元 快速发货 STR检测产品详情 说明书 相关产品 货号: HXSRM1287 形式: 基因组DNA(gDNA) 描述: CTCF ——(c.781+2T>C)...
专利摘要:本发明公开了一种多功能转录调控因子CTCF的DNA结合位点CTCF_13的新用途,即其在制备用于结直肠肿瘤早期诊断试剂盒中的应用,该结合位点核苷酸序列如SEQIDNO:1所示;本发明提供的CTCF结合位点无论是检测结直肠腺瘤还是结直肠癌的准确性都要显著高于已报道的DNA甲基化分子标记;而且CTCF的DNA结合位点还有可能成为肿...
货号: HXSRM1289 形式: 基因组DNA(gDNA) 描述: CTCF p.T204fs*26(c.603_604insA) 核苷酸变异: c.603_604insA 氨基酸变异: p.T204fs*26 等位基因频率: 49% 缓冲液: Tris-EDTA(10 mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0 浓度: 50 ng/uL 总量: 1 ug 运输条件: 常温运输 储存: -20 ℃保存36个月 ...