推测基因区域的DNA甲基化参与mRNA转录和加工过程,因此运用HCT116和DKO细胞进行聚腺苷化测序(poly(A)-seq)和DNA甲基化测序(MBD-seq),揭示了DNA甲基化与APA之间的显著关联。在缺失DNA甲基化修饰的情况下,甲基化敏感性绝缘蛋白,CCCTC结合因子(CTCF)结合并募集黏连蛋白复合体到poly(A)位点近端下游区域。该蛋白复合体与...
CTCF是一种染色质结构修饰因子,能够结合DNA并影响染色质的构象。它通过与特定序列的DNA结合,调节基因的表达和染色质的组织结构。研究表明,CTCF的结合能够影响组蛋白的修饰状态。 首先,CTCF能够与组蛋白H3和H4的特定位点相互作用,通过改变这些位点的乙酰化、甲基化等修饰状态,进而影响基因的表达。其次,CTCF的结合还能促进...
当CTCF结合序列的DNA甲基化时,它可以通过阻止CTCF介导的多梳蛋白抑制复合物2的募集过程来激活GAD1的表达,导致GAD1转录增加和mRNA表达增加。 值得注意的是,研究结果发现,在孤独症患者中发现的6个差异甲基化CpG位点中,有3个位于CTCF结合位点,其余差异CpG位点也非常接近CTCF结合位点(上下100个碱基对以内),提示孤独症患者...
推测基因区域的DNA甲基化参与mRNA转录和加工过程,因此运用HCT116和DKO细胞进行聚腺苷化测序(poly(A)-seq)和DNA甲基化测序(MBD-seq),揭示了DNA甲基化与APA之间的显著关联。在缺失DNA甲基化修饰的情况下,甲基化敏感性绝缘蛋白,CCCTC结合因子(CTCF)结合并募集黏连蛋白复合体到poly(A)位点近端下游区域。该蛋白复合体与...