CTCF不仅作为DNA转录因子,还能与DNA甲基化等分子相互作用,对组蛋白修饰分布产生显著影响。本文旨在探讨CTCF与DNA甲基化在细胞生物学中的作用,并进一步探讨两者对组蛋白修饰分布的具体影响。 二、CTCF的基本特征及其作用 CTCF是一种重要的转录因子,具有多种功能。它能够结合DNA,参与基因转录的调控,并与其他蛋白质相互
作者因此分析CTCF在DNA甲基化调节APA机制过程中与黏连蛋白复合物协同作用的可能性。黏连蛋白复合物组分RAD21和染色体结构维持蛋白SMC1的染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)结果表明,与HCT116细胞相比,DKO细胞这两种蛋白与CTCF蛋白都结合在HEATR2(图3A)和NFYA(图3B)基因未甲基的CGI处。此外,在DKO细胞中,Pol2Ser5p同样在该...
当CTCF结合序列的DNA甲基化时,它可以通过阻止CTCF介导的多梳蛋白抑制复合物2的募集过程来激活GAD1的表达,导致GAD1转录增加和mRNA表达增加。 值得注意的是,研究结果发现,在孤独症患者中发现的6个差异甲基化CpG位点中,有3个位于CTCF结合位点,其余差异CpG位点也非常接近CTCF结合位点(上下100个碱基对以内),提示孤独症患者...
推测基因区域的DNA甲基化参与mRNA转录和加工过程,因此运用HCT116和DKO细胞进行聚腺苷化测序(poly(A)-seq)和DNA甲基化测序(MBD-seq),揭示了DNA甲基化与APA之间的显著关联。在缺失DNA甲基化修饰的情况下,甲基化敏感性绝缘蛋白,CCCTC结合因子(CTCF)结合并募集黏连蛋白复合体到poly(A)位点近端下游区域。该蛋白复合体与...