CTCF(CCCTC结合因子)是一种在哺乳动物中高度保守的DNA结合蛋白,对染色质高级结构的调控至关重要。它通过结合特定DNA序列参与基因
CTCF是一种锌指蛋白,可以通过结合DNA序列中的特定区域来调节基因的表达。其结构包含11个锌指结构域,可以与DNA序列中的甲基化CpG岛、转录因子结合位点等区域结合,并介导染色质的三维结构形成。CTCF能够通过DNA的甲基化状态、染色质的拓扑结构等多种方式来调节基因的表达。 CTCF通过其结构域与DNA序列中的特定区域结合,形...
红细胞生成(erythropoiesis),作为造血过程中的关键环节,一直是生命科学领域的研究热点。红细胞从造血干细胞和祖细胞逐步分化而来,这一过程伴随着基因转录组、蛋白质组的重塑,以及 DNA 甲基化和染色质结构的改变 。然而,尽管科学家们对这一过程已经有了一定的了解,但其中仍有许多谜团等待解开。
结果发现,LAD既不直接沉默Zfp42R基因,也不间接阻断它们与Fat1增强子的联系。 5. DNA甲基化使Zfp42对肢体增强子不敏感 对已发表的ChIP-seq进行分析,发现在E11.5肢体的Zfp42R启动子处没有发现H3K27me3或H3K9me3富集,从而排除了多梳...
同时发现,Xi 的三维结构和 H3K27me3富集对多个逃脱基因的调控起着关键作用,而 DNA 甲基化则没有明显影响。这些发现为未来旨在干扰 Xi 上基因沉默或逃脱机制的研究提供了重要的见解,有助于进一步理解它们在人类健康和疾病中的作用。例如,对于一些与性别相关的疾病,或许可以从这些调控机制入手,寻找新的治疗靶点和策略...
DNA甲基化,mRNA可变剪切和多聚腺苷化(polyadenylation, APA)的失调与癌症密切相关。之前研究大多通过孤立分析其与不同生物进程之间的关系。本研究作者通过比较DNA甲基化转移酶正常细胞(HCT116)和双缺陷型细胞…
已有研究表明DNA甲基化、RNA结合、蛋白质-蛋白质相互作用等因素可影响CTCF的染色质结合【3-5】。但调控CTCF染色质精确结合的机制还未完全解析清楚。中山大学丁俊军教授长期关注CTCF与染色质三维结构调控机制的研究。2021年,丁俊军实验室在Cell...
首先，作者们分析CTCF是如何找到DNA上连续序列的，与前人报道相一致的是重组的人源CTCF能会识别单个CTCF结合位点，并且该过程会受到DNA上甲基化修饰的影响。因此，作者们在26.1kb的线性化DNA上引入了单个CTCF结合位点，将DNA两端附着在玻璃上，并通过Sytox Green染色对DNA分子进行可视化成像（图1）。图1 CTCF调节环...
首先,作者们分析CTCF是如何找到DNA上连续序列的,与前人报道相一致的是重组的人源CTCF能会识别单个CTCF结合位点,并且该过程会受到DNA上甲基化修饰的影响。因此,作者们在26.1kb的线性化DNA上引入了单个CTCF结合位点,将DNA两端附着在玻璃上,并通过Sytox Green染色对DNA分子进行可视化成像(图1)。
相反,这些因子并不明显占据驱动精子发生的种系特异性启动子,而是缺乏启动子-启动子的物理相互作用,并且即使在活跃时也具有DNA高甲基化。总体而言,ZBTB16 促进 uSPG 细胞周期进展,并与 SALL4、SOX3、CTCF 和 RNAPol2 共定位,帮助建立广泛且交互式的染色质平衡网络。https://doi.org/10.1038/s41594-025-01509-5...