2022年9月16日北京大学生命科学学院季雄课题组联合定量生物学中心齐志课题组在iScience杂志上发表了题为CTCF DNA binding domain undergoes dynamic and selective protein–protein interactions的研究论文,该文章揭示了CTCF的DNA结合结构域(DNA-binding Domain,DBD)能以不依赖无序结构域的方式形成动态的自聚集簇,在三维细...
本研究作者通过比较DNA甲基化转移酶正常细胞(HCT116)和双缺陷型细胞(DKO)全基因组甲基化和聚腺苷化位点使用情况,发现了DNA甲基化调控APA的机制。结果表明,去除DNA甲基化可以使CTCF(CCCTC-binding factor)与之结合同时招募黏连蛋白复合体,进而形成染色质环,促使近端聚腺苷化位点的使用。在DNA去甲基化的情况下,CTCF结...
进一步地，作者们对CTCF在环挤出的屏障作用进行检测，在31.8kb DNA的9.7kb位置出引入了单个CTCF位点，CTCF的N端朝向DNA更长的末端。随后进行Sytox Orange染色指示DNA的位置，加入从HeLa细胞中纯化的CTCF、重组的NIPBL-MAU2以及ATP。作者们发现N末端朝向的CTCF阻断DNA环挤出的比例远远高于反向的CTCF。该结果说明CTCF...
The DNA-binding factor Ctcf critically controls gene expression in macrophages. Cell. Mol. Immunol. 2014; 11 :58–70.Nikolic T, Movita D, Lambers ME, de Almeida CR, Biesta P, Kreefft K, de Bruijn MJ, Bergen I, Galjart N, Boonstra A, Hendriks R. The DNA-binding factor Ctcf ...
该基因属于boris+ctcf基因家族,编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文,所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶(hat)的复合物并作为转录激活剂发挥作用,或结合包含组蛋白脱乙酰基酶(hdac)的复合物并作为转录...
(CCCTC-binding factor) 该基因属于boris+ctcf基因家族,编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文,所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶(hat)的复合物并作为转录激活剂发挥作用,或结合包含组蛋白脱乙酰基酶(...
2022年9月16日北京大学生命科学学院季雄课题组联合定量生物学中心齐志课题组在iScience杂志上发表了题为“CTCF DNA binding domain undergoes dynamic and selective protein–protein interactions”的研究论文,该文章揭示了CTCF的DNA结合结构域...
摘要:CCCTC结合因子(CCCTC-binding factor,CTCF)是一种高度保守的多功能转录因子,含有11-锌指结构,可与DNA、蛋白质和RNA相互作用,参与基因的表达调控。CTCF可通过基因DNA甲基化水平的改变、基因突变、CTCF/Cohesin复合体、BORIS/CTCF系统调控CTCF的功能,参与肿瘤的发生和发展。该文就转录因子CTCF在肿瘤发展中的调控机制...
CTCF (CCCTC-binding factor)是一种重要的染色质架构蛋白,其与绝缘子的方向性结合在哺乳动物基因组三维空间结构形成和维持中起着至关重要的作用。正向-反向相对方向的CTCF结合位点(简称CTCF位点)可以在染色质黏连蛋白(cohesin)的协助下,形成染色质环,介导远距离DNA元件之间的相互作用;而在染色质拓扑结构域边界区域的CT...