16 Swarts DC, van der Oost J, Jinek M. Structural Basis for Guide RNA Processing and Seed-Dependent DNA Targeting by CRISPR-Cas12a. Mol Cell 2017; 66:221-233.e224. 17 Yamano T, Nishimasu H, Zetsche B et al. Crystal Structure of Cpf1 in Complex with Guide RNA and Target DNA. Cell...
结合2023年(详见BioArt报道:Cell | 畅磊福团队解析I-B型CRISPR系统引导Tn7-like转座子的分子机理)报道的PmcCascade-DNA-TniQ-TnsC复合体的结构模型【14】,团队搭建了完整的PmcCascade-DNA-TniQ-TnsC-TnsAB复合体的结构模型,并对两种...
除了通过PAM结合及在sgRNA–DNA互补基础上定向解旋DNA识别潜在靶序列,识别靶DNA序列驱动了HNH核酸酶结构域发生了构象改变。这一结构转变触发了RuvC结构域催化活性,确保了协调切割两条DNA链。部分互补的脱靶DNA序列或许可以稳定结合Cas9,但却无法驱动HNH构象改变,从而避免的切割。 近期获得了金黄色葡萄球菌sgRNA/DNA结合Cas9...
CRISPR/Cas诊断工具,称为基于Cas12a蛋白的DNA内切酶靶向CRISPR反式报告基因(DETECTR)。DETECTR技术使用V型酶(如Cas12a)切割单链DNA序列,分为三个阶段:(1)将Cas12a蛋白和靶crRNA整合进DNA报告探针中,一旦crRNA通过Cas12a蛋白识别其靶序列,Cas12a蛋白就会在激活切割能力后,靶向切割单链或双链DNA;(2)靶DNA...
基因编辑技术 (genome editing) 可以精确地破坏、插入或替换基因组中特定位点的 DNA 序列, 在基因功能的研究和遗传疾病的治疗中发挥着巨大的作用。人工核酸内切酶 (engineered endonuclease, EEN) 介导的基因编辑技术极大地改善了早期基于同源重组的基因打靶技术 (gene targeting) 效率低的问题, 使得科研工作者可以高效地...
[4] Swarts DC, van der Oost J, Jinek M. Structural Basis for Guide RNA Processing and Seed-Dependent DNA Targeting by CRISPR-Cas12a. Mol Cell. 2017 Apr 20;66(2):221-233.e4. doi: 10.1016/j.molcel.2017.03.016. [5] Barrangou R, Horvath P. A decade of discovery: CRISPR functions...
12 月 18 日《自然》(Nature)杂志在线发表了一篇题为 Structural basis of DNA targeting by a transposon-encoded CRISPR-Cas system 的新研究,来自哥伦比亚大学的科学家们利用冷冻电子显微镜捕获了一种新的基因编辑工具的首批图像。 该团队在霍乱弧菌中发现了一种独特的“跳跃基因”,其可以在不引入 DNA 断裂的情况...
1. Pilié PG, Tang C, Mills GB, Yap TA. State-of-the-art strategies for targeting the DNA damage response in cancer.Nat Rev Clin Oncol.2019 Feb;16(2):81-104. doi: 10.1038/s41571-018-0114-z. PMID: 30356138; ...
综上,研究人员使用CRISPR KO筛选技术揭示了化疗药物耐药的遗传原因和机制,强调了细胞周期异常、DNA损伤反应及肿瘤微环境重塑等主要驱动因素,并提出了针对这些耐药机制的有前途的生物标志物和治疗策略。这些发现为理解和克服化疗耐药性提供了宝贵的信息,特别是在结直肠癌中验证了PLK4作为奥沙利铂耐药的靶点。
基于其强大的DNA敲入效率和高保真性,HMEJ介导的敲入策略为构建靶向基因修饰的猴模型提供了可能性。该项工作由助理研究员姚璇、博士后刘真与研究生王兴在灵长类疾病模型研究组杨辉研究员与苏州灵长类研究平台主任孙强博士的指导下完成 而来自季维智、郭雪江与黄行许合作完成的研究中,研究人员基于他们过去在大鼠中运用CRISPR...