Mamba Conda通常在安装软件包时速度会很慢,这时候你可以选择用Mamba。 Mamba 是一个开源的包管理器,它是 Conda 的一个替代品,用于在 Python 环境中管理包和依赖关系。Mamba 使用了 C++ 编写的库,可以更快地解析和安装依赖关系,特别是在复杂的环境或有很多包需要安装时。 Mamba 的使用方式与 Conda 非常相似,因为...
采用mamba加速软件依赖解析 [mamba采用c++重写了部分解析过程,这个提速效果是很明显的] (安装好mamba后就可以用mamba替换conda进行安装了) conda install mamba -c conda-forge mamba install python=3.7.4 1. 2. ,默认conda解析软件依赖时优先考虑允许的最高版本,设置通道优先级权限高于软件版本新旧后,conda会能更...
对于Conda: conda activate myenv 激活虚拟环境后,你就可以在该环境中安装和管理Python软件包了。你可以使用以下命令来安装软件包:对于Mamba: mamba install packagename 对于Conda: conda install packagename 这些命令将自动从PyPI或Conda仓库中下载并安装指定的软件包。你可以根据需要替换“packagename”为你要安装的软...
现在新版的mamba支持开箱即用了,下载、初始化就可以使用。 # curl micro.mamba.pm/install.sh | bash curl -Ls https://micro.mamba.pm/api/micromamba/linux-64/latest | tar -xvj bin/micromamba ./bin/micromamba shell init -s bash -p /mambaforge/ source ~/.bashrc # mamba操作 micromamba acti...
1. Mamba的安装 mamba 是用C++重写了 conda 的部分功能,运行效率显著提高,可以进行并行的下载,使用管理工具中的 libsolv,可以更快的解决环境依赖问题。 Mamba可以使用Conda命令直接安装: conda install mamba -c conda-forge 当然,也可以去GitHub下载安装脚本: ...
conda install mamba -n base -c conda-forge 1. 通过mamba安装的方式和conda一样 mamba install package 1. 但是安装mamba的过程也需要conda install然后又会卡在Solving environment那里,逻辑闭环了属于是 方法三:更换镜像源 这也是很多博客里面提到的方法之一,我认为是治标不治本甚至也不治标,因为速度瓶颈主要在...
使用conda create -n your_env_name python=X.X(2.7、3.6等)命令可以创建python版本为X.X、名字为your_env_name的虚拟环境。your_env_name可以在Anaconda安装目录envs文件夹下找到。在创建虚拟环境时,还可以选择其他需要的包和库一起安装。一旦虚拟环境创建完成,我们可以使用activate命令来激活(或切换)到不同的...
在虚拟环境内输入:mamba install ipykernel ipython_genutils -y 执行python -m ipykernel install --user --name 虚拟环境名 --display-name "显示名称" 此命令中--name后的名称要和之前的环境名一致,--display-name后的名称可任取。 刷新Jupyter网页,之后点击左上角蓝色+号新建启动器即可看到虚拟环境了。
conda/mamba install -y fastqc conda/mamba install -y fastqc=0.11.9 conda/mamba install -c bioconda -c conda-forge -y fastqc=0.11.9 也可以在创建环境时安装软件 conda create -n env_name fastqc=0.11.9 -y conda也可以本地安装一些软件,但是我用不到,也没用过,不做介绍,有需要自行查阅教程。
condaenvcreate-nrna-frna.yaml# 如果有mamba的话可以用mamba安装# mamba env create -n rna -f rna.yamlcondaenvcreate-nR4-fR4.yaml 或者试试导入下面这个新的配置文件: 从钉钉群里下载RNA.env.txt 代码语言:sh 复制 conda create--nameRNA--fileRNA.env.txt# 这里--name 和 --file不能简写!