Mamba Conda通常在安装软件包时速度会很慢,这时候你可以选择用Mamba。 Mamba 是一个开源的包管理器,它是 Conda 的一个替代品,用于在 Python 环境中管理包和依赖关系。Mamba 使用了 C++ 编写的库,可以更快地解析和安装依赖关系,特别是在复杂的环境或有很多包需要安装时。 Mamba 的使用方式与 Conda 非常相似,因为...
采用mamba加速软件依赖解析 [mamba采用c++重写了部分解析过程,这个提速效果是很明显的] (安装好mamba后就可以用mamba替换conda进行安装了) conda install mamba -c conda-forge mamba install python=3.7.4 1. 2. ,默认conda解析软件依赖时优先考虑允许的最高版本,设置通道优先级权限高于软件版本新旧后,conda会能更...
现在新版的mamba支持开箱即用了,下载、初始化就可以使用。 # curl micro.mamba.pm/install.sh | bash curl -Ls https://micro.mamba.pm/api/micromamba/linux-64/latest | tar -xvj bin/micromamba ./bin/micromamba shell init -s bash -p /mambaforge/ source ~/.bashrc # mamba操作 micromamba acti...
envName为自己的mamba虚拟环境sourcedeactivate# 关闭环境,envName为自己的mamba虚拟环境mamba env list# 虚拟环境列表mamba createpython=3-n# 创建一个新的虚拟环境mamba list# 查看已经安装的包mamba update mamba# 升级mamba自身mamba update python#更新到最新版本的pythonmamba search# 查询包mamba install# 安装包...
conda install packagename 这些命令将自动从PyPI或Conda仓库中下载并安装指定的软件包。你可以根据需要替换“packagename”为你要安装的软件包的名称。总的来说,Mamba和Conda都是优秀的Python环境管理器,它们都能够方便地自动安装和管理Python软件包和环境。选择使用哪个工具主要取决于你的需求和偏好。通过熟悉它们的语法...
conda install mamba -n base -c conda-forge 1. 通过mamba安装的方式和conda一样 mamba install package 1. 但是安装mamba的过程也需要conda install然后又会卡在Solving environment那里,逻辑闭环了属于是 方法三:更换镜像源 这也是很多博客里面提到的方法之一,我认为是治标不治本甚至也不治标,因为速度瓶颈主要在...
在虚拟环境内输入:mamba install ipykernel ipython_genutils -y 执行python -m ipykernel install --user --name 虚拟环境名 --display-name "显示名称" 此命令中--name后的名称要和之前的环境名一致,--display-name后的名称可任取。 刷新Jupyter网页,之后点击左上角蓝色+号新建启动器即可看到虚拟环境了。
conda/mamba install -y fastqc conda/mamba install -y fastqc=0.11.9 conda/mamba install -c bioconda -c conda-forge -y fastqc=0.11.9 也可以在创建环境时安装软件 conda create -n env_name fastqc=0.11.9 -y conda也可以本地安装一些软件,但是我用不到,也没用过,不做介绍,有需要自行查阅教程。
condaenvcreate-nrna-frna.yaml# 如果有mamba的话可以用mamba安装# mamba env create -n rna -f rna.yamlcondaenvcreate-nR4-fR4.yaml 或者试试导入下面这个新的配置文件: 从钉钉群里下载RNA.env.txt 代码语言:sh 复制 conda create--nameRNA--fileRNA.env.txt# 这里--name 和 --file不能简写!
raise ArgumentError(self, _('conflicting subparser: %s') % name) argparse.ArgumentError: argument COMMAND: conflicting subparser: repoquery`$ /home/dr0y/anaconda3/bin/mamba update mamba`environment variables: CIO_TEST=<not set>CONDA_DEFAULT_ENV=dst_python3 ...