mamba 是一个类似 conda 的工具,他主要是用来进一步加速 conda 的下载(mamba 使用多线程下载)和冲突处理。一次安装,全局使用。 conda install mamba -y 安装cuda 记得切换 conda 环境!防止后续污染 base 环境。 注意本处安装 cuda 的目的是为了给 pytorch 这样的框架使用,仅能保证 pytorch 调用正常。 安装cuda 确...
提高conda 安装软件的速度,需要在 base 环境中安装 mamba ,激活小环境后 conda activate rna,使用 mamba 代替 conda 进行搜索、安装软件等。 conda deactivate##不要在小换环境下安装mamba,mamba是唯一一个特殊的软件,不需要安装在小环境里,其它的要安装在小环境里。conda install -y mamba##记得加-y参数,mamba ...
conda deactivate ##不要在小换环境下安装mamba,mamba是唯一一个特殊的软件,不需要安装在小环境里,其它的要安装在小环境里。 conda install -y mamba ##记得加-y参数, mamba install -y bowtie2 ##安装成功 which bowtie2 ##查找软件所在的位置 注意:很少用到mamba,一般用conda安装不行,再用mamba试一下 ...
conda install -y mamba 安装好之后运行mamba报错 ImportError:libarchive.so.13:cannot open shared objectfile:No such file or directory 处理 sudo apt-getinstall libarchive13 再次运行mamba,还是报错,不过错误不一样了 argument COMMAND: conflicting subparser: repoquery 解决 conda intall conda-libmamba-solver=...
conda install -y mamba ##记得加-y参数, mamba install -y bowtie2 ##安装成功 which bowtie2 ##查找软件所在的位置 注意:很少用到mamba,一般用conda安装不行,再用mamba试一下 mamba的安装软件 安装完成的标志:3个done 软件安装完成的标志-done
2.4.17 直接上 mamba Conda安装配置生物信息软件 Conda是一种通用包管理系统,旨在构建和管理任何语言的任何类型的软件。通常与Anaconda (集成了更多软件包,https://www.anaconda.com/products/individual)和Miniconda (只包含基本功能软件包, https://conda.io/miniconda.html)一起分发。
首先,mamba本身需要先通过conda来安装: conda install -c conda-forge mamba 1. 依赖python,所以这里慢也没办法,只有等。 mamba安装成功后,后续所有软件安装都可将conda替换为mamba了,如mamba install -y bwa。 如r下载: mamba install -c conda-forge r-base ...
2.4.17 直接上 mamba Conda安装配置生物信息软件 Conda是一种通用包管理系统,旨在构建和管理任何语言的任何类型的软件。通常与Anaconda (集成了更多软件包,https://www.anaconda.com/products/individual)和Miniconda (只包含基本功能软件包, https://conda.io/miniconda.html)一起分发。
有一些备选的发行版(Anaconda、Miniconda、Miniforge、MicroMamba 等),它们在捆绑哪些软件包以及从哪个渠道下载方面有所不同。 总之,自从 2020 年 4 月更改了许可条款以禁止商业使用以来,conda 生态系统成为了一个雷区。如果您在商业组织中工作,请非常仔细地审查您使用的任何内容。
curl micro.mamba.pm/install.sh|bash ## Linux 默认shell 使用zsh curl micro.mamba.pm/install.sh|zsh 这里我根据我个人环境,进行手动安装演示 下载micromamba 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 $ curl-Ls https://micro.mamba.pm/api/micromamba/linux-64/latest|tar-xvj bin...