conda install mamba -n base -c conda-forge 这里,-n base 表示在base环境中安装Mamba,-c conda-forge 表示从conda-forge这个conda频道安装。如果你希望在其他环境中安装Mamba,可以将base替换为你想要安装的环境名。 执行命令,等待安装完成: 按下回车键执行命令,然后等待安装过程完成。这可能需要一些时间,具体取...
conda activate ENV_NAME#ENV_NAME换为你所想装包的环境名 4、在命令行复制黏贴这段命令安装mamba,虽然也是要跑解析,但是一劳永逸 注意:环境目录一定一定一定不要有中文,否则必定报错 condainstall-c conda-forge mamba 注意:环境目录一定一定一定不要有中文,否则必定报错 5、等他跑完就完事啦,但凡所有conda insta...
conda无论是在remove还是install的时候,速度都太慢了,有时候甚至能长达半小时,还有内存泄漏问题(有一次执行conda remove的时候内存占用到了15G),因此经过我的一番冲浪,发现了mamba这个东西,甚至连伯克利都在推荐mamba而不是conda,下面是mamba的一段介绍: mamba is a reimplementation of the conda package...
安装R包时指定R的版本也会极大减小搜索空间 (R包因其数目众多,也是生物类软件依赖解析较慢的原因之一) conda install r-base=4.0.2 r-ggplot2=3.3.2 采用mamba加速软件依赖解析 [mamba采用c++重写了部分解析过程,这个提速效果是很明显的] (安装好mamba后就可以用mamba替换conda进行安装了) conda install mamba -...
提高conda 安装软件的速度,需要在 base 环境中安装 mamba ,激活小环境后 conda activate rna,使用 mamba 代替 conda 进行搜索、安装软件等。 conda deactivate##不要在小换环境下安装mamba,mamba是唯一一个特殊的软件,不需要安装在小环境里,其它的要安装在小环境里。conda install -y mamba##记得加-y参数,mamba...
conda install mamba -n base -c conda-forge 使用mamba 导出环境 激活环境后,使用 mamba env export 导出环境依赖: mamba env export --no-builds > environment.yml mamba 通常能更好地处理复杂的依赖关系,并且速度更快。 注意事项 避免冲突:确保 conda 和pip 安装的包之间没有版本冲突。如果可能的话,尽量通...
2.4.17 直接上 mamba Conda安装配置生物信息软件 Conda是一种通用包管理系统,旨在构建和管理任何语言的任何类型的软件。通常与Anaconda (集成了更多软件包,https://www.anaconda.com/products/individual)和Miniconda (只包含基本功能软件包, https://conda.io/miniconda.html)一起分发。
conda install -c conda-forge mamba 1. 依赖python,所以这里慢也没办法,只有等。 mamba安装成功后,后续所有软件安装都可将conda替换为mamba了,如mamba install -y bwa。 如r下载: mamba install -c conda-forge r-base 1. 出现如下: ...
解决conda install 太慢的问题 mamba 记录一下 ''' conda install -c conda-forge mamba ''' 安装之后,可以用mamba的多线程进行提速 ''' mamba install 包名 ''' 的确快乐很多,但似乎不做兼容性检查了?有待验证